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鱼腥草HMGR基因cDNA克隆、差异表达及蛋白质结构分析
  • ISSN号:0253-2670
  • 期刊名称:《中草药》
  • 时间:0
  • 分类:R282.12[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:怀化学院生命科学系民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室,湘西药用植物与民族植物学湖南省高校重点实验室,湖南怀化418008
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30870230); 湖南省科技计划项目(2013FJ6090,2014FJ4207); 湖南省高校创新平台开放基金项目(15K100); 湖南省生物类专业大学生创新训练中心资助; 植物学湖南省高校“十二五”重点建设学科资助(ZWX2016-07)
中文摘要:

目的克隆鱼腥草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因并分析其差异表达。方法采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)方法获得HMGR基因cDNA序列并对HMGR蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析,并预测该蛋白功能;利用RT-PCR方法检测HMGR基因在鱼腥草的地下茎、地上茎、叶、花中的表达情况。结果克隆获得的HMGR基因cDNA全长为1 626 bp,编码541个氨基酸。生物信息学预测HMGR蛋白含2个跨膜区,不含信号肽。HMGR基因主要在鱼腥草的花中表达,其他器官中表达相对较低,地下茎中表达量最低。结论首次从鱼腥草中克隆了HMGR基因,为进一步阐明该基因在鱼腥草萜类化合物代谢途径中的作用奠定基础。

英文摘要:

Objective To clone and analyze the expression difference sequence of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A redutase(HMGR) gene from Houttuynia cordata. Methods The sequence of HMGR was cloned from H. cordata by RT-PCR strategy. The physical and chemical properties, secondary structure, and three-dimensional structure of the HMGR protein were forecasted and analyzed, and its structure and function were predicted. And the different expression of HMGR gene in rhizome, stems, leaves, and flowers were analyzed by fluorescent quantitative PCR. Results The c DNA contained a 1 626 bp open reading frame and encoded a predicted protein of 541 amino acids. Two transmembrane regions and no signal peptide were present in HMGR. Relative real-time PCR analysis indicated that HMGR showed the highest transcript abundance in the flowers, and the lowest levels in the rhizomes. Conclusion This study cloned and expression analyzed HMGR gene from H. cordata for the first time. The result will provide a foundation for exploring the mechanism of terpenoid biosynthesis in H. cordata.

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期刊信息
  • 《中草药》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:天津市科委
  • 主办单位:中国药学会 天津药物研究院
  • 主编:汤立达
  • 地址:天津市南开区鞍山西道308号
  • 邮编:300193
  • 邮箱:zcy@tiprpress.com
  • 电话:022-27474913 23006821
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2670
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1108/R
  • 邮发代号:6-77
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双奖”期刊,1992年获国家科委、中共中央宣传部、国家新闻出版...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:90909