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温针灸对虚寒型膝骨关节炎基因表达通路的影响
  • ISSN号:0255-2930
  • 期刊名称:《中国针灸》
  • 时间:0
  • 分类:R734.2[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]河南中医学院生物化学与分子生物学学科,郑州450008, [2]新加坡国立大学数学系,新加坡117543, [3]成都中医药大学中医遗传学研究室,成都610075, [4]新加坡细胞分子生物学研究所,新加坡138673
  • 相关基金:国家自然科学基金海外青年学者合作项目(No.30528029); 河南省医学创新人才工程项目(No.2005075); 河南中医学院博士基金项目(No.2007005)
中文摘要:

目的:利用基因表达谱与基因功能知识识别虚寒证相关的差异基因与功能模块,从功能模块水平研究虚寒证发生的分子机制。方法:用Array Tools筛选差异表达基因,并检验分类效果,再利用Gene Ontology(基因本体,GO)工具,将特征基因进行功能注释,选择显著聚集差异表达基因的功能模块;识别其中能够有效分类疾病样本的特征功能模块,并分析它们与虚寒证的关联。结果:用25个差异基因分类样本准确率在93%,用11个功能模块分类样本准确率在87%-100%之间。结论:这些特征功能模块与虚寒证的发生有一定的关联性。基于特征功能模块法研究基因表达谱更有利于对疾病的阐释。

英文摘要:

Objective:To identify the deficient cold syndrome relevant genes and functional modules,based on gene expression profiles and gene functional knowledge to study the molecular mechanism of deficient cold syndrome.Methods:Screening the differential expression genes with Array Tools,and testing the classificational results to the samples.The Gene Ontology Tool was used for annotating characteristics functional gene,selecting functional modules enriched with differentially expressed genes;and then identifing the feature modules and analyzing their association with the deficient cold syndrome.Results:The accuracy rate of classification samples was 93% with 25 different gene,the accuracy rate was 87%-100% with 11 functional modules.Conclusion:These features function modules had some relevance to the occurrence of deficient cold syndrome.It was more favorable interpretation of the disease by studying functional modules based on gene expression profiles.

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期刊信息
  • 《中国针灸》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术学会
  • 主办单位:中国针灸学会 中国中医研究院针灸研究所
  • 主编:刘保延
  • 地址:北京东直门内南小街16号
  • 邮编:100700
  • 邮箱:zgzjzz@sina.com
  • 电话:010-84014411-2946 84014607
  • 国际标准刊号:ISSN:0255-2930
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2024/R
  • 邮发代号:2-53
  • 获奖情况:
  • 获国家中医药管理局优秀中医药科技期刊二等奖、一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:39942