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苦荞种质资源AFLP标记遗传多样性分析
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:中国农业科学
  • 时间:0
  • 页码:4166-4174
  • 语言:中文
  • 分类:S635.1[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学] S661.1[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]山西大学生物技术研究所/教育部化学生物学与分子工程重点实验室,太原030006, [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081, [3]国际生物多样性中心东亚办事处,北京100081
  • 相关基金:农业部农作物种质资源保护专项(BN07-2130135-(25-30)-10)
  • 相关项目:苦荞SSR引物开发、遗传连锁图谱构建及品种资源分析
中文摘要:

【目的】从分子水平研究苦荞种质资源的遗传多样性,为综合评价苦荞种质资源提供依据。【方法】用筛选出的20对AFLP引物,对14个不同地理来源的165份苦荞种质进行遗传多样性分析。【结果】共扩增出938条清晰的条带,其中314(33.48%)条呈多态性,平均每对引物组合的条带数和多态性带数分别为46.9个和15.7个。不同地理来源苦荞种质的Shannon-Weaver多样性指数为0.1093~0.2661,四川资源群最高,青海、云南和甘肃/宁夏等资源群次之,湖南资源群最低。利用Popgen Ver.1.32软件,依不同地理来源苦荞资源群间Nei′s遗传一致度可聚类成5个组,聚类结果与苦荞地理分布相关。基于Structure2.2软件分析,165份苦荞资源分为5大组群,并与Popgen Ver.1.32聚类结果呼应得较好,其中云南和四川资源的群体结构最复杂,最为多样化,分别被聚到了5个组群中。【结论】苦荞类群的亲缘关系以及遗传多样性与其地理分布有一定相关性。

英文摘要:

【Objective】 The genetic diversity of tartary buckwheat accessions was analyzed at molecular level,and the helpful information for breeding and germplasm evaluation was obtained.【Method】 The genetic diversity of 165 accessions of tartary buckwheat from 14 different geographical regions was analyzed using 20 informative primer pairs of AFLP markers.【Result】 Totally 938 loci were detected among which 314(33.48%) were polymorphic.The number of amplified fragments and polymorphic fragments per primer combination were 46.9 and 15.7,respectively.Shannon's information index of different geographical groups was 0.1093-0.2661.The group from Sichuan possessed the highest level of genetic diversity,followed by those from Qinghai,Yunnan and Gansu/Ningxia.The group from Hunan was the lowest in genetic diversity.Five cluster groups were identified based on the dendrogram of pairwise Nei's genetic identity.The clustering results revealed that the genetic diversity of accessions of tartary buckwheat closely related to their origins.Five types of population structure within 165 tartary buckwheat accessions were inferred by structure analysis,which also correlated to their geographic origins.The population structure of accessions from Yunnan and Sichuan provinces were the most complicated and multiplex.【Conclusion】 The result showed that the genetic relationship and diversity of tartary buckwheat populations correlated to their geographic distribution to a certain extent.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620