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三峡水库156m蓄水前后澎溪河回水区藻类多样性变化特征
  • ISSN号:1003-5427
  • 期刊名称:湖泊科学
  • 时间:2012
  • 页码:227-231
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华中师范大学生命科学学院湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室,武汉430079, [2]青海大学医学院,西宁810016
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(No.31060013)
  • 相关项目:水下光热结构对三峡水库调度运行的响应及其诱导蓝藻水华的生态机制
中文摘要:

从青海湖20份水样筛选得到一株优势中度嗜盐菌QHL1,经初步鉴定为盐单胞菌属.设计保守基因ectB的引物,以基因组DNA为模板,PCR扩增获得ectB基因(1269 bp).利用染色体步移技术,克隆获得四氢嘧啶合成基因簇ectABC及其上下游调控序列.DNAStar软件分析表明ectA、ectB和ectC位于同一个操纵子上,大小分别为579 bp、1269 bp和390 bp,预测分别编码192、422和129个氨基酸的肽链.同源性分析表明:Halomonas sp.QHL1 ectABC基因簇所编码的二氨基丁酸转乙酰基酶(EctA)、二氨基丁酸转氨酶(EctB)和四氢嘧啶合成酶(EctC)与Halomonas sp.Nj223 ectABC基因簇所编码的酶蛋白相似性分别达57%、96%和85%.利用分子克隆技术构建二氨基丁酸转氨酶基因ectB的重组表达载体pET-28-ectB,通过限制性内切酶酶切和测序分析,结果表明其目的基因的插入位置、大小和读码框均正确.诱导表达重组菌,SDS-PAGE分析,目的蛋白条带约46 kDa.

英文摘要:

The moderate halophile QHL1 isolated from 20 water samples of Qinghai Lake was preliminarily identified as a member of the genus Holomonas. The conserved ectB gene of 1269bp from this strain was amplified by PCR. The ectABC gene cluster for biosyn- thesis of ectoine was further cloned by genome walking methods. Analysis of the DNAStar software showed that ectA, ectB and ectC genes organized as an operon and the size were 579bp, 1269bp and 390bp predicting to encode peptides of 192, 422 and 129 amino acids, respectively. The deduced amino acid sequences of EctA, EctB and EctC shared 57% , 96% and 85% identity to 2, 4-diami- nobutyric acid acetyltransferase, 2, 4-diaminobutyric acid transaminase and ectoine synthase of Halomonas sp. Nj223 respectively ac- cording to homology analysis. The recombinant expression vector pET-28-ectB was constructed by molecular cloning. Indueion and ex- pression of the recombinant strain by IPTG and SDS-PAGE showed that the relative molecular mass of the expression product was 46kDa as predicted.

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期刊信息
  • 《湖泊科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院南京地理与湖泊研究所 中国海洋湖沼学会
  • 主编:沈吉
  • 地址:南京市北京东路73号
  • 邮编:210008
  • 邮箱:jlakes@niglas.ac.cn
  • 电话:025-86882041 86882040
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-5427
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1331/P
  • 邮发代号:28-201
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国工程索引,美国地质文献预评数据库,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:16668