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杜氏盐藻核基质附着区结合蛋白cDNA片段的克隆及序列分析
  • ISSN号:1671-6825
  • 期刊名称:《郑州大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q781[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]郑州大学细胞生物学研究室,郑州大学第一附属医院临床医学重点学科开放实验室,郑州450052, [2]新乡医学院生物化学与分子生物学教研室,新乡453003
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目30270031,30470030;教育部高等学校博士学科点专项科研基金资助项目20050459007
中文摘要:

目的:克隆杜氏盐藻核基质附着区(MAR)结合蛋白片段。方法:根据多种生物MAR结合蛋白氨基酸的高度保守序列EWYGWHF和KYGLIYQ,设计一对简并引物,以杜氏盐藻的cDNA为模板,进行PCR扩增,PCR产物与T载体相连,转化大肠杆菌JM109后,筛选鉴定,对阳性菌落进行测序分析。将测序结果推导成氨基酸序列,与GenBank上其他物种MAR结合蛋白序列进行同源性分析。结果:在杜氏盐藻中得到的eDNA片段,核苷酸长度为474bp,编码158个氨基酸(GenBank收录号为DQl24215)。推导的氨基酸序列与稻、莲、拟南芥、豌豆、烟草、酵母、果蝇和蟾的MAR结合蛋白相比较,同源性分别为74%、73%、73%、73%、71%、70%、68%和67%。结论:所克隆的序列可能为杜氏盐藻MAR结合蛋白片段。

英文摘要:

Aim : To clone MAR-binding protein cDNA fragment from Dunaliella salina. Methods :A pair of degenerate primers were designed according to the homologous amino acid conserved sequences of EWYGWHF and KYGLIYQ from known MAR-binding protein and used to amplify MAR-binding protein cDNA fragment from Dunaliella salina by PCR technique. The resulting PCR product was cloned into pMD18-T vector and then transformed into E. coll JM109. Several colonies were selected and screened to determine their sequences. Homologous analysis of the deduced amino acid sequences was performed by BLAST and compared with those of GenBank. Results: An obtained cDNA sequence was 474 bp long,which encoded 158 amino acids( GenBank accession number:DQ124215). The sequence shared high homology with other MAR-binding proteins, being Oryza sativa 74% , Lotus corniculatus var. japonicus 73% , Arabidopsis thaliana 73%, Pisum sativum 73%, Nicotiana tabacum 71% , Schizosaccharomyces pombe 70% , Drosophila melanogaster 68% and Xenopus laevis 67%, respectively. Conclusion: The cloned sequence is probably MAR binding protein cDNA fragment from Dunaliella salina.

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期刊信息
  • 《郑州大学学报:医学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:河南省教育厅
  • 主办单位:郑州大学
  • 主编:辛世俊
  • 地址:郑州市高新区科学大道100号
  • 邮编:450001
  • 邮箱:xzshi@126.com
  • 电话:0371-67781728
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-6825
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1340/R
  • 邮发代号:36-111
  • 获奖情况:
  • 综合性医药卫生类核心期刊,教育部优秀科技期刊一等奖,中国优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15607