近年来,我国政府在食品安全监管体系方面进行了大量的积极探索和改革,对保障食品安全发挥了非常重要的作用,但是仍然存在一些问题。针对这些问题,运用基于主体建模的方法,建立一个食品供应链的计算机仿真模型,以此为基础通过一系列的仿真实验,探讨政府监管方式和措施对相关行为主体的影响及其监管效果,并得出通过加强政府监管力度,有利于供应链的组织结构趋于紧密的纵向协作,进而有利于食品安全水平的提高的结论。最后,据此有针对性地提出政府应通过多种形式的组织将分散的小农户联结起来、利用供应链的内部治理机制来控制农户的行为等对策建议。