位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
DENGENE:一种高精度的基于密度的适用于基因表达数据的聚类算法
  • ISSN号:1001-3695
  • 期刊名称:《计算机应用研究》
  • 时间:0
  • 分类:TP18[自动化与计算机技术—控制科学与工程;自动化与计算机技术—控制理论与控制工程] TP301.6[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]中国科学院软件研究所互联网软件技术实验室,北京100080, [2]香港理工大学计算学系生物识别中心,香港, [3]中国科学院软件研究所计算机科学重点实验室,北京100080, [4]中国科学院研究生院,北京100049
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(60373053);中国科学院“百人计划”基金资助项目;中国科学院与英国皇家学会联合资助项目(20030389,20032006);留学回国人员科研启动基金项目([2003]406)
中文摘要:

摘要:根据基因表达数据的特点,提出一种高精度的基于密度的聚类算法DENGENE。DENGENE通过定义一致性检测和引进峰点改进搜索方向,使得算法能够更好地处理基因表达数据。为了评价算法的性能,选取了两组广为使用的测试数据,即啤酒酵母基因表达数据集对算法来进行测试。实验结果表明,与基于模型的五种算法、CAST算法、K-均值聚类等相比,DENGENE在滤除噪声和聚类精度方面取得了显著的改善。

英文摘要:

According to the characteristics of gene expression data, a high accurate density-based clustering algorithm called DENGENE was proposed. DENGENE achieves good clustering by defining homogeneity test and peak points. To evaluate the performance of DENGENE, two budding yeast Saccharomyces cerevisiae data sets, which are widely used as test data sets, were used to validate the effectiveness of DENGENE. The experiment results show that compared with five model-based clustering algorithms, CAST and K-means clustering, DENGENE filters noises effectively and produces more accurate clustering resuits.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《计算机应用研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:四川省科学技术厅
  • 主办单位:四川省计算机研究院
  • 主编:刘营
  • 地址:成都市成科西路3号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:arocmag@163.com
  • 电话:028-85210177 85249567
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-3695
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1196/TP
  • 邮发代号:62-68
  • 获奖情况:
  • 第二届国家期刊奖百种重点科技期刊,国内计算技术类重点核心期刊,国内外著名数据库收录期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:60049