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基于分子信标的有机磷农药适配体活性位点分析及改造
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:TQ453.22[化学工程—农药化工]
  • 作者机构:[1]南京农业大学食品科技院,南京210095, [2]安徽科技学院食品药品学院,凤阳233100, [3]江苏省食品质量安全重点实验室,农业部食品质量安全监控重点开放实验室,南京210014
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30871658); 江苏省农业自主创新项目(No.CX(10)236); 农业部948项目(No.2011-Z46,2011-G5-7)资助
中文摘要:

设计了一个长度为20个核苷酸的分子信标,建立了有机磷农药和分子信标竞争结合适配体鉴定其活性的方法,对前期筛选的两条适配体进行了活性位点分析和改造。结果表明,分子信标设计合理,性能稳定,其发夹结构在室温下既可成功闭合也可成功打开,最佳的活性鉴定条件为分子信标与适配体添加比例1.25∶1,孵育时间50 min,孵育温度为室温。活性位点分析表明Loop2-4是4种有机磷农药共有的活性位点,Loop2-3及SS4-54适配体5'端和3'端残余的核苷酸是甲拌磷重要的活性位点,Loop2-2和Loop4-2是丙溴磷和水胺硫磷共有的活性位点,Loop4-3是丙溴磷和氧化乐果共有的活性位点,Loop2-1和Loop4-1是水胺硫磷重要的活性位点。通过基因拼接改造的SS24-PJ-35适配体对丙溴磷和水胺硫磷的结合活性明显提高。

英文摘要:

A competitive inhibition method based on a molecular beacon containing 20 nucleotides was developed for the active site analysis and modification of two organophosphorusate pesticides aptamers that had been selected in our previous study.The results indicated that the designed molecular beacon formed a hairpin structure,and the loop could be opened up in the presence of complementary aptamer sequence.The ratio of molecular beacon to aptamer of 1.25 to 1,incubated time of 50 min and incubation at room temperature were chosen as optimal conditions of active site analysis.Under optimal conditions,the Loop2-4 was a mutual active site for four organophosphorus pesticides,Loop2-3 and the nucleotides at 3′ and 5′ of the SS4-54 aptamer were important active sites for phorate,Loop2-2 and Loop4-2 were mutual active sites for profenofos and isocarbophos,Loop4-3 was a mutual active site for profenofos and omethoate,Loop2-1 and Loop4-1 were important active sites for isocarbophos.The binding activity for profenofos and isocarbophos of SS24-PJ-35 aptamers modified by gene splicing significantly increased.

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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455