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山东地区水貂肠炎病毒VP2基因的克隆和测序分析
  • ISSN号:0529-6005
  • 期刊名称:《中国兽医杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:青岛农业大学山东省预防兽医学重点实验室,山东青岛266109
  • 相关基金:科技部科技基础性工作专项(2012FY111000);公益性行业(农业)科研专项(201303042);山东省自主创新及成果转化专项(2014ZZCX07105);山东省农业重大应用技术创新课题;山东省农业科技成果转化资金项目
中文摘要:

本研究对潍坊、烟台、威海和青岛地区的疑似水貂病毒性肠炎病毒(MEV)粪便样品进行检测,并在9份样品QD1309、QD1407、WH1407、WH1408、WH1508、WH1509、WF1310、WF1408、YT1408中扩增出VP2基因,和Gen Bank上已经公布的4株MEV参考株的VP2基因进行序列分析,结果显示,13份MEV VP2基因的核苷酸和氨基酸均有较高的同源性,分别为97.5%99.8%和96.9%99.7%。系统发育进化树表明,QD1309、YT1408、MEV-Beregovoj-Bincentr(MEV-BB)、MEV-e属于同一个组群,不同毒株主要在第5、62、87、101、232、236、279、300、534位氨基酸发生了替换。本研究对水貂细小病毒流行株的主要衣壳蛋白VP2的编码蛋白进行遗传变异分析,为更好地预防和控制貂源细小病毒提供基础。

英文摘要:

We tested samples of suspected parvovirus feces in Weifang,Weihai,Yantai,and Qingdao and got 9 VP2 genes from QD1309,QD1407,WH1407,WH1408,WH1508,WH1509,WF1310,WF1408,and YT1408. We compared them with 4 MEV VP2 genes out or in our country from Gen Bank. Results showed that the 13 MEV VP2 genes had high homology of nucleotide and amino acids,which were 97. 5% 99. 8% and 96. 9% 99. 7%. Phylogenetic analysis showed that QD1309,YT1408,MEV-BB,and MEVe belonged to the same group,and the difference for different strains were mainly at the site of 5,62,87,101,232,236,279,300,and534 amino acid.

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期刊信息
  • 《中国兽医杂志》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:张克家
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号
  • 邮编:100193
  • 邮箱:vetzzhi@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733040
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-6005
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2471/S
  • 邮发代号:2-137
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19671