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鉴别犬瘟热病毒强弱毒株SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立
  • ISSN号:0529-6005
  • 期刊名称:《中国兽医杂志》
  • 时间:0
  • 分类:S852.655[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]青岛农业大学山东省预防兽医学重点实验室,山东青岛266109, [2]山东省蓬莱市畜牧局,山东蓬莱264003
  • 相关基金:公益性行业(农业)科研专项(201303042); 科技基础性工作专项(科技部)(2012FY111000)
中文摘要:

为建立犬瘟热强弱毒株SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法,根据Gen Bank公布的犬瘟热毒株的全基因序列并参考相关文献,选择M基因保守区域合成了1对通用引物M1/M4及鉴别犬瘟热强弱毒株的特异引物M2和M3。试验证明,该方法重复性良好;检测强弱毒株的最低检出限度在10拷贝;对新城疫病毒、水貂肠炎病毒、阿留申病毒、犬腺病毒、犬细小病毒5种病毒的特异性检测均为阴性;对175份犬瘟热疑似病料进行荧光定量RT-PCR,检出127份阳性样品,其中强毒株98份,弱毒疫苗株29份,常规RT-PCR检出112份阳性样品。结果表明,该方法的敏感性高于常规RT-PCR检测,并能有效的鉴别强弱毒株。

英文摘要:

SYBR GreenⅠReal-time RT-PCR was developed for the detection and identification of wild-type and vaccine strains of canine distemper virus( CDV). According to the differences of whole gene sequence of M gene in the strains of CDV in Genebank,two pairs of primers,universal primer M1 and M4 and specific primers M2 and M3 were designed to differentiate wild-type and vaccine strain of CDV. The developed RT-PCR could detect minimum 10 copies for wild-type and vaccine strains and specifically differentiate NDV,MEV,ADV,CAV,and CPV. SYBR GreenⅠReal-time RT-PCR and normal PCR detected 127 positive samples and 112 positive samples,respectively. Twenty-nine positive samples were vaccine strain in 127 positive samples detected by SYBR GreenⅠReal-time RT-PCR. This results show that the sensitivity of this assay is higher than normal RT-PCR,which can also differentiate wild-type and vaccine strains of CDV.

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期刊信息
  • 《中国兽医杂志》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:张克家
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号
  • 邮编:100193
  • 邮箱:vetzzhi@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733040
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-6005
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2471/S
  • 邮发代号:2-137
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19671