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条纹斑竹鲨线粒体控制区和细胞色素b基因序列分析
  • ISSN号:1000-3096
  • 期刊名称:海洋科学
  • 时间:0
  • 页码:35-41
  • 语言:中文
  • 分类:Q959.423[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]厦门大学海洋与环境学院,福建厦门361005, [2]集美大学水产学院,福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,福建厦门361021
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(40776083,40876080);厦门市科技项目(3502220063022)
  • 相关项目:中国近海不同群体条纹斑竹鲨的种质鉴别与分子标记研究
中文摘要:

对厦门和湛江海域的条纹斑竹鲨Chiloscyllium plagiosum(Bennett,1830)]的线粒体DNA控制区和细胞色素6(Cytb)基因进行PCR扩增和测序,获得线粒体DNA控制区、Cytb基因和tRNA^Pro。基因全序列(GenBank序列号:EU363740~EU363752)。结果表明,tRNA^Pro。基因长度为69bp,控制区长度为1094~1096bp,Cytb基因全序列长度为1146bp。tRNA^Pro。基因非常保守,未发现碱基变异。所测30个个体中,控制区只有4个多态位点,5种不同的单倍型;Cytb基因全序列共有10个多态性位点,7种单倍型。Cytb基因的1146个碱基编码381个氨基酸,氨基酸链共有3个变异位点,4种单倍型,厦门群体具有4种单倍型,湛江群体只有1种单倍型。综合Cytb基因和控制区序列,2个条纹斑竹鲨群体共有10种单倍型,其中厦门群体有9种单倍型,湛江群体仅4种单倍型。研究结果表明条纹斑竹鲨在控制区和Cytb基因序列上的遗传多样性均较低,厦门群体的遗传多样性水平高于湛江群体。

英文摘要:

Genetic diversities of Chiloscylliurn plagiosum (Bennett, 1830) from Xiamen and Zhanjiang were investigated with mitochondrial control region and cytochrome b (Cyt b )gene sequence analysis. Control region and Cyt b gene fragments from 30 individuals were cloned with PCR method and sequenced. The sequences of the mitochondrial control region, Cyt b gene and tRNA^Pro gene were obtained. The complete sequences of the mitochondrial control region, Cyt b gene and tRNA^Pro gene were 69 bp,1 094-1 096 bp and 1 146 bp respectively, tRNA^Pro gene seemed conservative, without any polymorphism. Among 30 samples, there were 4 polymorphyism sites with 5 haplotypes for control region sequence and 10 polymorphyism sites with 7 haplotypes for Cyt b gene sequence. 1 146 bp nucleotide of Cyt b gene encoded 381 amino acids, and the amino acid chain had 3 polymorphyism sites with 4 haplotypes. Samples of Xiamen stock had 4 haplotypes while Zhanjiang stock only 1 haplotype. It was seemed that the genetic diversities in Cyt b and control region from C. plagiosurn in Xiamen were comparatively higher than those in Zhanjiang,though both appeared relatively low.

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期刊信息
  • 《海洋科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院海洋研究所
  • 主编:侯一筠
  • 地址:青岛南海路7号
  • 邮编:266071
  • 邮箱:dehail@ms.qdio.ac.cn
  • 电话:0532-82898751
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3096
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1151/P
  • 邮发代号:2-655
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21338