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苦荞重组自交系群体F_5代SSR遗传图谱的构建
  • ISSN号:1004-5570
  • 期刊名称:《贵州师范大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:S517[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵州贵阳550001, [2]贵州师范大学荞麦产业技术研究中心,贵州贵阳550001
  • 相关基金:国家现代农业产业体系专项(CARS-08-A4);国家自然科学基金项目(31460280);贵州省科技厅科学技术基金项目(黔科合JZ字[2014]2011号);贵州省科技厅-贵州师范大学联合基金项目(黔科合LH字[2016]7224号);贵州师范大学博士研究项目
中文摘要:

以"小米荞×晋荞2号"杂交组合,通过单粒传获得的245个F_5代重组自交系(命名为SJ-RILs)群体为作图材料,构建SSR遗传连锁图谱。结果显示:350对SSR引物在亲本间有多态性的为59对,多态率为16.9%;多态性引物在SJ-RILs群体共扩增出80个等位变异位点;来自小米荞和晋荞2号等位基因分别占群体总基因型的51.5%和48.5%;采用作图Jionmap4.0软件构建的遗传连锁图总长度为1 106.74cm,含11个连锁群,80个分子标记,其中偏分离标记27个,相邻标记的平均间距为13.83cm。结论:该图谱可为苦荞遗传图谱构建、重要性状QTL的定位和基因组学研究隆奠定基础。

英文摘要:

In this study,245 tartary buckwheat( F. tataricum) F_5 recombinant inbred lines developed from a cross between Small Rice buckwheat and Jinqiao2( named as SJ-RILs) population was employed to construct a genetic linkage map with microsatellite( SSR) markers. Result: Of 350 pairs of SSR primers screened,59( 16. 9%) were polymorphic between the two parental lines,and totally 80 polymorphic loci were detected in the SJ-RILs population; The alleles from Small Rice buckwheat and Jinqiao2 accounted for 51. 5% and 48. 5% of total loci,respectively; A genetic linkage map of1 106. 74 centimorgans( cm) was established by Jionmap4. 0 software,which was consisted of 11 linkage groups and 80 SSR markers including 27 segregation distortion markers. The average distance was13. 83 cm between adjacent markers. Conclusion: The genetic linkage map generated in the present study provides a basis for genetic linkage map construction,QTL mapping of important traits and genomic studies in tartary buckwheat.

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期刊信息
  • 《贵州师范大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:贵州师范大学
  • 主办单位:贵州师范大学
  • 主编:伍鹏程
  • 地址:贵州省贵阳市宝山北路116号
  • 邮编:550001
  • 邮箱:gznu@sohu.com
  • 电话:0851-6762237 6771335
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-5570
  • 国内统一刊号:ISSN:52-5006/N
  • 邮发代号:66-51
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校自然科学学报三等奖,教育部优秀期刊三等奖,贵州省优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),德国数学文摘,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:5675