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中国35个苦荞审定品种EST-SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析
  • ISSN号:2095-0837
  • 期刊名称:《植物科学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵阳550001, [2]贵州师范大学荞麦产业技术研究中心,贵阳550001
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31460280);国家现代农业产业体系荞麦育种岗位科学家专项资金(CARS-08-A4);贵州省科技厅科学技术基金(黔科合JZ字[2014]2011号);贵州师范大学博士基金项目(11904-05032130025,11904-0514027).
中文摘要:

核心引物对种质资源遗传多样性分析、品种鉴定、指纹图谱构建等研究具有重要价值。本研究以35个苦荞(Fagopyrum tataricum(L.)Gaertn)审定品种为材料,从91对苦荞EST—SSR引物中筛选出50对多态性引物。综合考虑引物多态性信息量(PIC)大小、鉴别力(DP),筛选出等位变异位点数在2~4,PIC值在0.60~0.78之间的6对引物(SSR9007、SSR6873、SSR7642、SSR2234、SSR6789、SSR68216)构建了供试品种的分子指纹图谱。遗传多样性聚类分析结果表明,供试品种的相似系数为0.50~0.99。当遗传相似系数为0.60时.可将供试品种分为4大类群,其中54.3%的供试品种被聚为一类,表明苦荞审定品种遗传组成差异较小,遗传基础狭窄。聚类结果表明各类群间没有明显的地域分布趋势,但能较好的反映供试品种间的亲缘关系。

英文摘要:

Core primers are important in genetic diversity analysis, cultivar identification, and fingerprinting construction. In this study, 91 pairs of EST-SSR primers were screened using 35 registered tartary buckwheat cultivars, with 50 primers showing polymorphism. Based on the polymorphism information content (PIC) and discrimination power (DP) results, a core set of six SSR primers (SSR9007, SSR6873, SSR7642, SSR2234, SSR6789, and SSR68216) were further selected to construct fingerprinting of the 35 cultivars, with alleles amplified by each pair of primers ranging from 2 to 4 and PIC values ranging from 0.60 to 0.78. The UPGMA cluster analysis showed that the genetic similarity of the 35 cultivars varied from 0.50 to 0.99. The cultivars were divided into four groups based on a genetic similarity of 0.60, with 54.3% remaining clustered together, indicating a close genetic relationship and narrow genetic basis. The genetic relationship was in accordance with their breeding history, but was not affected by their geographic differences.

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期刊信息
  • 《植物科学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院武汉植物园、湖北省植物学会
  • 主编:李绍华
  • 地址:武汉市武昌磨山中科院武汉植物园内
  • 邮编:430074
  • 邮箱:editor@wegcas.cn; zwkxbjb@wbgcas.cn
  • 电话:027-87510755
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-0837
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1817/Q
  • 邮发代号:38-103
  • 获奖情况:
  • 获“1994-1995”年度湖北省优秀期刊,1997年获第二届全国优秀科技期刊三等奖,2000年获第四届中科院优秀期刊三等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1276