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松墨天牛铁蛋白重链相似物的cDNA克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:广东农业科学
  • 时间:2014
  • 页码:147-150-
  • 分类:S763.38[农业科学—森林保护学;农业科学—林学] Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华南农业大学林学院,广东广州510642
  • 相关基金:国家自然科学基金(31170612)
  • 相关项目:氯胺磷、吡虫啉和溴氰菊酯胁迫下松墨天牛分子响应的比较研究
中文摘要:

昆虫铁蛋白(ferritin)由两个亚基组成,类似于脊椎动物铁蛋白的重链和轻链.从松墨天牛(Monoc hamusahe rnatus)cDNA文库中筛选出erritin基因的重链同源物(HCH) cDNA序列,其开放阅读框(ORF)长669 bp,编码222个氨基酸,命名为Mafer,GenBank登录号为KJ872588,该序列推测的蛋白分子质量为25.8 ku,等电点为5.72.预测的松墨天牛ferritin信号肽长度为18个氨基酸残基,在5'非编码区没发现铁反应元件(IRE),N末端有保守的半胱氨酸,符合脊椎动物重链特点.相似性比对显示,松墨天牛ferritin与光肩星天牛(Anoplophora glabripennis)和桑天牛(Apriona germari) ferritin的相似性分别为93%和69%;系统进化树分析显示,松墨天牛与光肩星天在同一分支下,与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)亲缘关系较远.

英文摘要:

Insect ferritin is composed of two subunits, which are similar to heavy and light chains of vertebrate ferritins. A heavy chain homologue (HCH) cDNA of Monochamus alternatus, designated as Mafer (GenBank: KJ872588) was obtained from a previously constructed DNA library. The open reading frame of Mafer is 669 bp in length, encoding 222 amino acid residues with calculated molecular mass of 25.8 ku and isoeleetric point of 5.72. Among the predicted Mafer protein sequence, a 18 amino acid signal peptide and cysteine domain were found, wich is in accord with the HCH of vertebrates. But Mafer contains no iron responsive element (IRE) at its 5'-UTR. The sequence alignment shows that Mafer has 93% and 69% identity with A noplophora glabripennis HCH and Apriona germari HCH, respectively. Phylogenetic analysis indicats that M. alternatus and A. glabripennis was on the same branch, and M. alternatus is distantly related with Drosophila melanogaster.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995