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2株狂犬病街毒株全基因组测序及分子进化研究
  • ISSN号:1000-5684
  • 期刊名称:《吉林农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.65[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]吉林农业大学动物科技学院,长春130118
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30070542)
中文摘要:

利用RT-PCR方法,对梅花鹿源(DRV)和鼠源(MRV)2个狂犬病毒街毒株进行全基因组测序,获得2个毒株全基因组序列(GenBank登录号分别为DQ875051和DQ875050)。DRV和MRV毒株全基因组分别与具有代表性的毒株全基因组进行N、P、M、G、L基因的核苷酸和氨基酸同源性比较。不同毒株的全基因组构建的分子系统进化树表明,DRV和MRV分属2个进化支。DRV与Ni-CE、RC-HL和SRV9的亲缘关系最近;MRV与HEP-Flury的亲缘关系最近,并与HHV-RAB-H街毒株同属一个进化支。

英文摘要:

Trough RT- PCR, DRV(isolated from deer)1 and MRV (islolated from mouse)street virus strains were amplified and cloned, then the whole genome was sequenced and two whole genomic se-quences(accession numbers are DQ875051 and DQ875050 at GenBank respectively ) were obtained. The whole genomes of DRY and MRV were compared with the representative strains of genomes about nucleotide and amino-acid homology of N, P, M, G and L genes. Finally, inductive sunnnary of 5 genic homology was made in comparison with data and features. The molecular phylogenetic tree of the whole genome of different strain constructions indicate that DRV and MRV belong to two evolutive branches. DRV, Ni-CE, RC-HL and SRV9 have the closest homologic relation; MRV and HEP-Flury have the closest homologic relation, and belong to one evolutive branch with HHV-RAB-H street virus.

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期刊信息
  • 《吉林农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:吉林省教育厅
  • 主办单位:吉林农业大学
  • 主编:秦贵信
  • 地址:吉林省长春市新城大街2888号
  • 邮编:130118
  • 邮箱:jlndxb@vjlav.edu.cn
  • 电话:0431-84532914
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5684
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1100/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊,全国中文农业类核心期刊,中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16398