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4C-克隆筛选过程中的质量控制
  • 期刊名称:遗传
  • 时间:2011
  • 页码:404-410
  • 分类:S888.3[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]军事医学科学院生物工程研究所,北京100071
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(编号:30871374)资助
  • 相关项目:一种体外转座辅助的染色质相互作用研究的新策略
中文摘要:

环形染色体构象俘获(Circular chromosome conformation capture,4C)是一种高通量研究细胞染色体相互作用、空间构象的技术。文章通过模拟的4C样品,优化反向PCR条件,建立了高效、特异的扩增方法,对4C克隆筛选等后续步骤进行严格的质量控制并对该方法的可行性进行了实例验证。该4C-克隆筛选方法作为4C方法的质量控制标准,具有重要的指导和监测作用。

英文摘要:

Circular chromosome conformation capture (4C) can be used to analyze the high-resolution interaction map of cis-regulatory elements in genome-wide studies. In this study, we optimized the condition of PCR with the inimical 4C sample in order to establish a specific and efficient assay, which was validated practically. This 4C-clone screening assay can be used as the quality control in the application of 4C assay.

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