中文摘要：

转录工厂是由活跃形式的RNAPII相互聚集形成的一种亚细胞超微结构，主要负责基因的转录。通过染色质免疫沉淀与染色体构象俘获、高通量测序技术的结合，建立了一种研究染色质三维相互作用的超高通量筛选技术4CALLs，进行了ESC中起始、延伸形式RNA聚合酶II以及增强子结合蛋白P300介导的染色质相互作用的高通量筛选、鉴定、生物信息学注释及其生物学功能等研究，结果发现P300和不同形式的 RNAPII分别介导以增强子为核心的增强子-增强子EP、增强子-启动子EP和以启动子为核心的启动子-启动子PP、启动子-增强子EP、启动子-基因转录区PG等复杂相互作用网络，形成一对一、一对多、多对一的EE、EP、PP等不同模式；RNAPII主要介导细胞类型非特异的基因间相互作用，延伸阶段RNAPII还介导巨大内含子间的相互作用，可能与miRNA的表达调控相关；P300主要介导细胞类型特异性、功能相关基因的增强子、启动子相互作用；相互作用基因活跃表达，且相互协调。上述结果提示在真核生物存在基于染色质相互作用的基因表达三维调节，不同基因共享转录工厂可能真核基因表达有效调节方式，与原核生物的操纵子模型相对应。