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节杆菌A.pascens DMDC12中SOD基因的克隆和序列分析
  • ISSN号:1005-7021
  • 期刊名称:《微生物学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q556.9[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]南京市疾病预防控制中心,江苏南京210003, [2]南京工业大学制药与生命科学学院,江苏南京210009
  • 相关基金:国家重点基础研究发展规划项目(973项目,2004CB719600)
中文摘要:

根据基因库中细菌SOD的基因保守序列和Arthrobacter pascens DMDC12的N-末端氨基酸序列设计引物。采用PCR技术,以A.pascens DMDC12基因组为模板,克隆了A.pascens DMDC12中Mn—SOD的567bp的基因片段;再结合该基因片段和A.pascens DMDC12中SOD的N-末端氨基酸序列的有关信息,设计包含该sod完整ORF区域的引物,成功扩增了A.pascens DMDC12中Mn—SOD的基因序列,新sod序列(sodAP)已提交Gen-Bank(收录号DQ779150)。利用生物学软件对该序列进行分析表明,该sodAP序列的ORF区域全长651bp,编码216个氨基酸;该序列和Arthrobactersp.FB24的SOD基因序列同源性为86%。

英文摘要:

A primer was designed according to conservative sequence of SOD gene in GenBank and amino acid sequence of N-terminal in Arthrobacter pascerts (Ap) DMDC12, then a 567 bp gene fragment of Mn-SOD from Ap DMDC12 was cloned adopting PCR and using genome of AP DMDC12 as a template. Combining the gene fragment and relevant information of N-terminal amino acid sequence of SOD from Ap DMDC12 a primer containing SOD complete ORF domain was designed and successfully amplified the Mn-SOD gene sequence in Ap DMDCI2. The new SOD sequence (SODAP) was submitted to GenBank (No. DQ779150). Sequence analysis using biological software indicated that the length of ORF domain of SODAP was 651 bp encoding 216 amino acids, the homology of the sequence was 86% with SOD sequence from Arthrobacter sp. FB24.

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期刊信息
  • 《微生物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省科学技术委员会
  • 主办单位:中国微生物学会 辽宁省微生物学会 辽宁省微生物科学研究院
  • 主编:张忠泽
  • 地址:辽宁省朝阳市双塔区龙山街四段820号
  • 邮编:122000
  • 邮箱:lnwswxh@126.com
  • 电话:0421-2914613 2976840
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-7021
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1186/Q
  • 邮发代号:8-142
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊,中国生物学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:11311