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从鳗弧菌M3 Fosmid文库筛选aroA基因
  • ISSN号:1002-0470
  • 期刊名称:《高技术通讯》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] S858.315.1[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国海洋大学海洋生命学院,青岛266003, [2]中国科学院海洋研究所,青岛266071, [3]不详
  • 相关基金:973计划(2006CB101803)、863计划(2006AA6100310)和国家自然科学基金(30471335)资助项目.
中文摘要:

为克隆鳗弧菌aroA基因(它在细菌中编码合成芳香族氨基酸的关键酶——5-烯醇氏丙酮酰莽草酸3-磷酸(EPSP)合成酶),在实验室中构建了鳗弧菌M3大分子量基因组Fosmid文库,并通过克隆测序获得了部分序列,以此为基础,通过延伸测序获得了aroA基因序列全长。该基因全长1281bp,编码427个氨基酸,包含一个11个氨基酸残基的信号肽;编码区GC平均含量为46.8%,推测分子量为46177Da。相似性分析表明,鳗弧菌的aroA核苷酸和氨基酸序列与其他弧菌的相似性最高,分别在73%-75%和78%~82%;进化树结果也表明鳗弧菌aroA与其他弧菌的亲缘关系最近。aroA基因的克隆为构建鳗弧菌弱毒疫苗奠定了基础。

英文摘要:

The aroA gene of Vibrio anguillarum, which encodes 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate (EPSP) synthase, was cloned and sequenced from the Fosmid library of Vibrio anguillarum M3 strain. The full-length sequence of the aroA consists of 1281bp, encoding for 427 amino acids with a calculated molecular mass of 46177 dahons, and its GC content is 46.8 %. The aroA contains a putative signal peptide of 11 amino acid residues. The similarity analysis indicated the aroA of V. anguillarum has high nucleotide and amino acid sequence homology with those of other bacteria, with the identities of 73%-75% and 78%-82%, and phylogenetic analyse showed it has a close relationship with the other bacteria of Vibiro sp. The present result opens a window to access to the study of attenuated live vaccines of V. anguillarum.

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期刊信息
  • 《高技术通讯》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国科学科技部
  • 主办单位:中国科学技术信息研究所
  • 主编:赵志耘
  • 地址:北京市三里河路54号
  • 邮编:100045
  • 邮箱:hitech@istic.ac.cn
  • 电话:010-68514060 68598272
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-0470
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2770/N
  • 邮发代号:82-516
  • 获奖情况:
  • 《中国科学引文数据》刊源,《中国科技论文统计与分析》刊源
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘
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