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长松萝中非核糖体肽合成酶ⅣRPS基因克隆与鉴定
  • ISSN号:1672-8246
  • 期刊名称:《西部林业科学》
  • 时间:0
  • 分类:R284[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学] R285[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:[1]云南省林业科学院,云南昆明650201, [2]云南省森林植物培育与开发利用重点实验室,国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室,云南昆明650201, [3]云南农业大学,资源与环境学院,云南昆明650201
  • 相关基金:国家自然科学青年科学基金项目(31400488),云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010C1016).
中文摘要:

非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(UsNRPS),并对得到的UsNRPS进行生物信息学分析、分子系统进化分析及基因表达分析。结果表明:在地衣型真菌中,非核糖体肽在长松萝中为首次发现,BLAST比对表明其为NRPS基因的A结构域,生物信息学分析显示UsNRPS蛋白是一种非分泌蛋白,位于细胞质基质中;分子进化分析显示UsNRPS与埃默森蓝状菌(Rasamsonia emersonii)的NRPS基因的A结构域蛋白聚为一类;RT—PCR分析表明:2%肌醇、10%甘露醇、2%山梨醇、2%葡萄糖、10%葡萄糖、0.2%谷氨酰胺、1%甘氨酸、0.2%丙氨酸能够诱导NRPS基因的轻微表达,2%、10%蔗糖和果糖均能诱导NRPS基因的强烈表达;0.2%、1%的天冬氨酸均抑制NRPS基因的诱导表达。

英文摘要:

Taking Usnea longissima lichen were cloned by homology-based cloning and molecular phylogeny evolution and genetic forming fungi as the materials, gene walking approaches, and inducible expression were also the segment and full length of NRPS relevant analysis on its bioinformatics, conducted. For the lichen fungi, the non-ribosomal peptide was first reported inUsnea longissimi, and the BLAST comparison shows that it is at A ( adenylation) structure domain of the NRPS sgene. The bioinformatics analysis shows NRPS is a kind of secreted protein, which located in cytoplasmic matrix. The A domain proteins of NRPS gene of both UsNRPS and Rasamsonia emersonii were clustered. The RT-PCR analysis reveals that 2 % inositol, 10 % mannitol, 2 % sorbitol, 2 % glucose, 10 % glucose, 0. 2 % glutamine, 1% glacine, 0. 2 % alanine could induce the expression of NRPS slightly, 2 % , 10 % sucrose and fructose could lure the expression of NRPS heavily, while 0. 2 % , 1% asparagines could suppress the expression of NRPS.

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期刊信息
  • 《西部林业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:云南省林业厅
  • 主办单位:云南省林业科学院 云南省林学会
  • 主编:王卫斌
  • 地址:昆明市黑龙潭云南省林业科学院内
  • 邮编:650201
  • 邮箱:jwcfs@vip.163.com
  • 电话:0871-65151502
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-8246
  • 国内统一刊号:ISSN:53-1194/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊奖,云南省优秀期刊奖,改革创新奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:4931