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野桑蚕线粒体ND5基因及其两端侧翼tRNA基因的克隆与序列分析
  • ISSN号:0257-4799
  • 期刊名称:《蚕业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S885.9[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]苏州大学生命科学学院,苏州215123
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划“973”项目(编号2005CB1210000);国家自然科学基金项目(编号30571404).
中文摘要:

应用PCR技术,对中国山东青州野桑蚕mtDNA的ND5基因及其两端侧翼区域进行了克隆和序列分析。结果表明,在所测定的2.2kb左右的片段中,含有ND5基因的完整序列及Phe-tRNA(UUC)、Ser-tRNA(AGC)、Glu-tRNA(GAA)、His-tRNA(CAC)等4个tRNA基因,该片段的基因组结构与家蚕及其它地域来源野桑蚕的基因组结构基本一致,显示蚕类线粒体基因排列的保守性。ND5结构基因在不同家蚕及野桑蚕之间的比对分析表明,它们在核苷酸水平、氨基酸水平的同源性很高,相似性迭96%以上。4个tRNA基因的碱基错配率较高,TψC环缺乏相对保守的T-ψ-C-Pu-A序列,各臂的碱基配对数、各环碱基数目变化较大。以ND5基因的核苷酸序列及氨基酸残基序列进行了家蚕及野桑蚕的分子进化分析,进一步证明家蚕起源于中国野桑蚕。

英文摘要:

The ND5 gene and its pericentric flanking region from mitochondrial DNA (mtDNA) of Bombyx mandarina M. from Qingzhou, Shangdong Province, was cloned and sequenced. The results indicated that the sequenced fragment, about 2.2 kb, contained a intact ND5 gene and 4 tRNA genes i. e. Phe-tRNA (UUC), Ser-tRNA (AGC), Glu-tRNA (GAA) and His-tRNA (CAC) genes. And the genome structure of the fragment is in accordance with that of other strains of Bombyx mori L, and Bombyx mandarina M. fundamentally. Therefore, mtDNA genes of silkworms are conservative in arrangement. Further analysis of various Bombyx mori L. and Bombyx mandarina M. showed that their ND5 genes are highly homologous at nucleotide and amino acid level with over 96% identities. But the 4 tRNA genes showed high mismatch rate. Their TψC-Ioops lack the relative conservative sequence of T-ψ-C-Pu-A, and the base pair numbers of each stem and the base number of each loop vary strikingly, Additionally, the molecular evolutionary analysis was carried out based on the sequences of nucleotide and amino acid of ND 5 gene, which furtherly supports the fact that Bombyx mori L. stems from Bombyx mandarina M..

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期刊信息
  • 《蚕业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会 中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:郭锡杰
  • 地址:江苏省镇江市四摆渡中国农业科学院蚕业研究所
  • 邮编:212018
  • 邮箱:CYKE@chinajournal.net.cn
  • 电话:0511-85616835
  • 国际标准刊号:ISSN:0257-4799
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1115/S
  • 邮发代号:28-23
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊,全国农业学会优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7742