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多重PCR技术鉴定旋毛虫虫种及其应用
  • ISSN号:1002-2694
  • 期刊名称:《中国人兽共患病学报》
  • 时间:0
  • 分类:R383.15[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]郑州大学医学院寄生虫学教研室,郑州450052
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30671834 30972579); 郑州大学研究生科学研究基金项目(No.02802Z)联合资助
中文摘要:

目的通过分析旋毛虫线粒体基因分子标记,研究我国旋毛虫地理株间的遗传变异与系统发生关系。方法应用旋毛虫线粒体核糖体小亚基DNA(mitochondrial small subunit ribosomal DNA,mtSSU)和线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因(mitochondria cytochrome coxidase,COΙ)为分子标记,分别对我国7个旋毛虫地理株扩增后进行双向测序,利用DNAMAN软件将测序结果和GenBank中相应序列进行比对研究,并使用MEGA4.0程序包构建系统进化树。结果 PCR对7个旋毛虫地理株分别扩增出了649bp(mtSSU)和419bp(COΙ)的DNA片段,7个地理株的DNA片段与GenBank中T.spiralis的相应片段相比存在一定差异,其中mtSSU基因有4个变异位点(248、293、537和539位),而COI基因仅存在2个变异(273和382位),所有变异均为T-C或C-T的转换;进化树显示南阳株和云南株位于比较近的分枝,而西安株、广西株及西藏株亲缘关系较近。结论我国7个旋毛虫地理株的遗传变异较小,亲缘关系较近。

英文摘要:

Genetic variation and phylogenetic relationship of Trichinella isolates in China were studied by analysis of mitochondrial cytochrome coxidase gene(COI) and mitochondrial small subunit ribosomal DNA(mtSSU) as molecular markers.The DNA fragments from the 7 Trichinella isolates from China were amplified by PCR-based methods.The genetic distances and sequence similarity were compared with the corresponding sequences of T.spiralis in GenBank by using the DNAMAN software.The phylogenetic trees were constructed by MEGA 4.0 with Neighbor-joining method.The results showed that the DNA fragments with 649bp(mtSSU)and 419bp(COΙ) from the 7 isolates were amplified,and some different with that of T.spiralis in GenBank.The mtSSU gene had four variable sites(248,293,537,and 539),COI gene had only two variable site(273 and 382),and all the type of genetic variations were conversion of C-T or T-C.Based on the phylogenetic tree,Nanyang and Yunnan isolates were close,while the phylogenetic relationship of Tibet,Xi'an and Guangxi isolates were closer.The results demonstrated that the genetic variation of the 7 T.spiralis isolates from China was small and their phylogenetic relationship was close.

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期刊信息
  • 《中国人兽共患病学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 主编:严延生
  • 地址:福州市津泰路76号
  • 邮编:350001
  • 邮箱:rsghb@fjcdc.com.cn
  • 电话:0591-87552018
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-2694
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1284/R
  • 邮发代号:34-46
  • 获奖情况:
  • 中国基础医学核心期刊,中国生物医学核心期刊,中国科学引文数据库列为来源期刊及统计源,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9000