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一种碟式微流控结晶芯片与传统结晶板的蛋白质结晶能力比较
  • ISSN号:0427-7104
  • 期刊名称:《复旦学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:TQ342.25[化学工程—化纤工业]
  • 作者机构:[1]复旦大学生命科学学院生理学与生物物理学系,上海200438, [2]中国科学院上海微系统与信息技术研究所纳米技术实验室,上海200050, [3]上海工业微生物工程技术研究中心,上海200438
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(2012CB933303,2011CB707505); 上海市科学技术委员会(13DZ2252000); 上海市重点学科建设(B111); 国家自然科学基金(61271161,61271162); 国家基础科学人才培养基金(J1210012)
中文摘要:

设计并制作了一种在微腔中对蛋白质进行微批量法(microbatch)结晶的碟式微流控结晶芯片,它是一种高通量、低成本、低耗样量(纳升级)、操作简便的蛋白质结晶筛选方法,这种芯片能成功地结晶溶菌酶(lysozyme)和青色荧光蛋白(CyPet).为了系统地比较这种微流控芯片与传统的使用蒸汽扩散法(vapor diffusion)的24孔结晶板的结晶能力,用3个Hampton结晶试剂盒(Crystal Screen KitⅠ、Crystal Screen KitⅡ和PEG/Ion Screen Kit),在4℃及20℃培养条件下分别对5种标准蛋白(溶菌酶(lysozyme)、木聚糖酶(xylanase)、脂肪酶B(lipase B)、葡萄糖异构酶(glucose isomerase)和嗜热菌蛋白酶(thermolysin))进行了结晶筛选实验.结果表明,在4℃时微流控芯片与24孔结晶板有相近数目的结晶条件(91 vs 98);在20℃时虽然微流控芯片上的结晶条件数少于24孔结晶板(67 vs 94),但主要是嗜热菌蛋白酶的结晶条件数显著减少,其他4种蛋白在两种方法上均有相近的结晶条件数,表明微流控芯片能以接近24孔结晶板的效率进行蛋白质结晶筛选.但是,在4℃时微流控芯片与24孔结晶板有60%的结晶条件不同,20℃时有90%的结晶条件不同,这表明目前的这种微流控芯片还不能直接代替传统的24孔结晶板,它可以作为蛋白质结晶筛选时的一种补充方式.

英文摘要:

Previously we designed a disk-like microfluidic chip that can crystallize proteins using the method of microbatch in microchambers. It has been proven to crystallize lysozyme and CyPet successfully and reduce the consumption of protein samples to nanoliters. However, no systematical comparison has been made between this new device and traditional methods in protein crystallization. To investigate whether the microfluidic chip is as effective as the conventional 24 well crystallization plate which using hanging-drop vapor diffusion method in protein crystallization screening, here, we performed an extensive comparison between these two methods by screening five standard proteins (lysozyme, xylanase, lipase B, glucose isomerase and thermolysin) in three Hampton crystal screen kits (Crystal Screen Kit I , Crystal Screen Kit Ⅱ and PEG/Ion Screen Kit) at 4 ℃ and 20 ℃. For the total of 146 crystallization conditions, the mierofluidic chips had similar number of crystallization hits at 4 ℃ (91 vs 98 conditions). While at 20 ℃ the microfluidic chips had less number of crystallization hits (67 vs 94 conditions). But four proteins showed similar number of crystallization hits except thermolysin. This result indicates the microfluidic chip works as efficient as conventional crystallization plate. However, about 60% crystallization conditions at 4 ℃ and 90% crystallization conditions at 20 ℃ were different between these two methods, which means the present microfluidic chip cannot directly replace but can be a supplement to the traditional 24 well crystallization plate for protein crystallization screening.

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期刊信息
  • 《复旦学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:复旦大学
  • 主编:杨玉良
  • 地址:上海市邯郸路220号
  • 邮编:200433
  • 邮箱:likexuebao@fudan.edu.cn
  • 电话:021-65642666
  • 国际标准刊号:ISSN:0427-7104
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1330/N
  • 邮发代号:4-193
  • 获奖情况:
  • 国家“双百”期刊,1999年获上海高校优秀自然科学学报评比一等奖,1999年获教育部系统优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:8838