对雌激素受体ERa和ER8与抑制剂244结合的体系进行了12ns的分子动力学模拟,用MM-PBSA方法计算了体系的结合自由能,抑制剂与ERa的结合自由能是-30.11kJ/mol,与ERB的是-33.32kJ/mol。ERct中Met421侧链原子与抑制剂间的静电排斥作用使活性口袋周围的残基构象发生变化,导致活性区域中结合空穴变大,从而使EROL与抑制剂的亲和性降低。自由能分解计算进一步说明了各个残基对自由能的贡献。