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Rapid Amplification of Flanking Sequences of a Known DNA Region by Partial Restriction Digestion and Hot Start PCR
  • ISSN号:1674-4918
  • 期刊名称:《植物分类学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:S642.2[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学农业部南方蔬菜遗传改良重点开放实验室,江苏南京210095, [2]江苏农林职业技术学院,江苏镇江212400
  • 相关基金:国家自然科学基金重点项目(30830079); 国家自然科学基金项目(30671419 30700541); 国家863专项经费项目(2008AA10Z150 2006AA100108 2006AA10Z108); 教育部111计划项目(B08025)
中文摘要:

以黄瓜品种露丰为材料,根据已报道的6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(6PGDH)的保守氨基酸序列设计简并引物,利用RT-PCR技术获得黄瓜6PGDH的cDNA同源片段,命名为CSPG(登录号为EU815934)。该片段长度为1 207 bp,包含一个936 bp的开放阅读框(编码311个氨基酸)和271 bp的Poly A 3′非翻译区末端,无内含子;该基因编码的氨基酸序列与拟南芥、大豆、水稻、玉米、菠菜的6PGDH基因有75%以上的同源性。运用半定量RT-PCR技术对6PGDH基因的转录水平进行分析,结果表明:该基因在叶、根、茎中均有表达,高温胁迫下的表达量高于常温对照,说明6PGDH基因与热胁迫相关。

英文摘要:

With homology-based PCR strategy,a fragment cDNA named CSPG(accession number EU815934) was cloned from Cucumis sativus‘Lufeng'.The length of CSPG was 1 207 bp,which encompassed an open reading frame(ORF) with 936 bp encoding 311 amino acid residues and 271 bp non-translation 3'-terminal end region,and no intron existed in CSPG.The protein encoded by CSPG was more than 75%highly homologous 6-phosphogluconate dehydrogenase gene(6PGDH) of Arabidopsis thaliana, Glycine max,Oryza sativa,Zea mays,Spinacia oleracea.The expression of 6PGDH was analyzed by semi-quantitative RTPCR indicating that the gene had expression in leaf,root and stem,and that the amount of expression was higher in heat stress than normal temperature.Which showed that expression of 6PGDH was related to heat stress.

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期刊信息
  • 《植物分类学报:英文版》
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院植物研究所 中国植物学会
  • 主编:陈之端 仇寅龙
  • 地址:北京香山南辛村20号
  • 邮编:100093
  • 邮箱:jse@ibcas.ac.cn
  • 电话:010-62836572 62836132
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-4918
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5779/Q
  • 邮发代号:2-226
  • 获奖情况:
  • 2001年 中国期刊方阵“双百期刊” 中国新闻出版总...,2000年 中国科学院优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库
  • 被引量:30