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香樟延伸因子EF1a基因片段的克隆及表达分析
  • ISSN号:1673-923X
  • 期刊名称:《中南林业科技大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S792.23[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学] Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]南阳师范学院生命科学与技术学院,河南南阳473000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31100511);河南省高校青年骨干教师计划项目(2010GGJS-161);南阳师范学院博士科研启动项目(nynu200746):2015年度研究生创新项目(2015CX008)
中文摘要:

通过同源克隆的方法从香樟Cinnamomum camphora中分离到一个编码延伸因子EF1a的cDNA序列片段。根据已经在GenBank中登录的其它物种的EF1a基因的保守序列设计一对兼并引物,通过反转录PCR技术获得一个1297 bp的基因片段。同源比对表明:CcEF1a与GenBank中注册的其它植物EF1a基因核苷酸序列的相似性均在80%以上,氨基酸序列的相似性高达96%以上。将所获得基因片段命名为CcEF1a并提交GenBank,登录号为KM086740。实时定量PCR结果显示,CcEF1a在低温胁迫下的叶片中表达量稳定,可以在实时定量PCR分析中作为内参基因。

英文摘要:

A cDNA fragment encoding a putative protein of elongat ion factor 1 alpha (EF1a) was ifrstly isolated from Cinnamomum camphora by using homology cloning, A pair of degenerate primers was designed based on the conserved sequences of other EF1a genes from the different species from GenBank, and a fragment of 1 297 bp was obtained through Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) techniques. The results of homologous alignment show that CcEF1a shared over 80%nucleotide sequence identity and over 96%amino acid sequence identity with EF1a genes in other plants that had been submitted to GenBank. The cDNA fragment sequence was named CcEF1a and registered in GenBank with accession number KM086740. According to the results of real-time quantitative PCR, the mRNA level of CcEF1a in leaves under chilling stress was identical. It could be used as an interrnal control in real-time quantitative PCR.

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期刊信息
  • 《中南林业科技大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南省教育厅
  • 主办单位:中南林业科技大学
  • 主编:赵运林
  • 地址:湖南长沙市韶山南路498号
  • 邮编:410004
  • 邮箱:xb-csfu@163.com
  • 电话:0731-85623395 85623278
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-923X
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1470/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1999年被评为全国高优秀学报二等奖,湖南省高校优秀学报一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11201