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辣椒N基因介导抗根结线虫作用早期表达基因的抑制性消减杂交SSH分析
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:《园艺学报》
  • 时间:0
  • 分类:S641.3[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学植物保护学院,陕西杨凌712100, [2]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30671412,30270236);科技部‘973’重大基础研究前期研究专项(2004CCA05300)
中文摘要:

以含N基因的辣椒(Capsicum annuumL.)为试验材料,接种南方根结线虫(Meloidogyne incognita)12、24、36h的根尖材料作为测验方(tester),相应的未接种根尖材料作为驱动方(driver),构建一个南方根结线虫诱导N基因表达早期的正向抑制消减杂交cDNA文库,并结合文库高密度点阵膜杂交差异筛选,获得了237条表达序列标签(EST)。在GenBank上进行BLASTn与BLASTx分析,得到148条功能已知的EST序列,获得已知的上调抗性相关EST68个。分离出了具有NBS-LRR结构的抗线虫蛋白和类LRR抗性蛋白的基因,防御作用相关的类萌芽素(GLP)、HSR203J蛋白、蜜腺蛋白、蛇毒素肽等基因,抗性相关的WRKY、ERFBP等转录因子基因,以及G蛋白、14-3-3蛋白等多种信号蛋白基因。通过Gene Ontology分析,N基因介导的早期表达抗病基因涉及病原物的识别、抗性信号传导、过敏性坏死、系统获得性抗性以及植物细胞保护机制等多个方面,并有许多功能未知的基因有待于进一步的研究。

英文摘要:

The nematode resistant gene N is a single dominant gene in pepper cuhivar Carolina Wonder (Capsicum annuum L. ). To investigate the early up-regulated expression genes profile in cuhivar Carolina Wonder induced by root-knot nematode (Meloidogyne incognita, RKN), a forward subtracted cDNA library was constructed using suppression subtractive hybridization (SSH). The cDNA of pepper seedling root tips inoculated with J2 RKN for 12, 24 and 36 h were used as tester and that from untreated root tips as driver. Totally 237 RKN-induced SSH cDNA fragments were selected with DIG Nonradioactive Nucleic Acid Labeling and Detection System. Based on the sequencing and BLAST analyzing of 148 fragments, 68 up-regulated expression EST fragments were identified, including the genes encode nucleotide-binding site/leucine-rich repeat (NBS-LRR) disease resistant proteins and LRR resistance protein-like; some defense proteins, such as Germin-like protein, HSR203J protein-like, Nectarin, and Snakin-2; some biostress resistance related transcription factor like WRKY and ERFBP; some signal proteins, such as GRP-like protein and 14-3-3 family protein. The Gene Ontology analysis revealed that the up-regulated ESTs involved in the recognition to nematode, signal transduction, protection mechanism, HR and SAR. In addition, some ESTs of unknown function may be novel genes.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371