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致肾盂肾炎大肠杆菌132的比较蛋白质组学研究
  • ISSN号:0254-5101
  • 期刊名称:《中华微生物学和免疫学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R394[医药卫生—医学遗传学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]天津医科大学基础医学院微生物教研室,300070
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30470096)
中文摘要:

目的研究致肾盂。肾炎大肠杆菌(UPEC)132与UPEC J96及非致病性大肠杆菌K-12MG1655的蛋白质组表达差异。方法采用双向凝胶电泳技术(2-DE)比较UPEC 132、UPEC J96与非致病性大肠杆菌K-12MG1655的菌体蛋白表达图谱差异,差异蛋白用胰蛋白酶进行胶内酶切,肽混合物使用基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪(MALDI—TOF—MS)进行质谱分析,将肽质量指纹谱数据输入互联网上的蛋白质数据库进行检索。结果UPEC132识别蛋白点数(466±11)明显高于Ecoli K-12 MG1655(338±15),也高于UPEC J96(382±12);3菌株共有的蛋白点为298个,2株UPEC共有的蛋白点为56个,UPEC 132特有的蛋白点为89个。MALDI—TOF—MS分析获得UPEC132特异的及显著上调表达的蛋白点22个,涉及毒力因子、物质代谢转运、蛋白合成调节、生物氧化及未知功能的多种蛋白质。结论UPEC菌株与非致病性大肠杆菌间的蛋白质组存在差异,UPEC 132与J96蛋白质组间也有显著不同,为其致病机制的深入研究提供线索。

英文摘要:

Objective To study proteome variation between uropathogenic E. coli (UPEC)132, UPEC J96 and non-uropathogenic E. coli K-12 MG1655. Methods Two-dimensional gel electrophoresis(2- DE ) was applied to compare the differential expression proteins between UPEC 132, UPEC J96 and non-uropathogenic E. coli K-12 MG1655. The differential expression proteins were digested in gel by enzyme. The mass of generated peptides were measured by matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). The data obtained from peptide mass fingerprinting (PMF) were researched using the internet available database. Results The number of protein spots recognized from UPEC 132 was 466± 11, significantly more than that of E. coil K-12 MG1655 (338 ± 15) and UPEC J96(382 ± 12) ; there were 298 protein spots shared by the three E. coli strains, 56 protein spots shared by two UPEC strains, and 89 protein spots characterized by UPEC 132. Twenty-two differential expression or significantly increased expression protein spots, involved in virulence factors, metabolism and transportation, regulation of protein synthesis, biological oxidation and unknown functions, were successfully identified by MALDI- TOF-MS. Conclusion The proteome from UPEC 132 and non-uropathogenic E. coli K-12 MG1655, or UPEC 132 and UPEC J96 was differentially expressed. It will provide important information on the pathogenesis of UPEC 132.

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期刊信息
  • 《中华微生物学和免疫学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:北京市经济技术开发区经海二路38号
  • 邮编:101111
  • 邮箱:cjmia@163.com
  • 电话:010-52245168
  • 国际标准刊号:ISSN:0254-5101
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2309/R
  • 邮发代号:2-55
  • 获奖情况:
  • 1995年中华医学会优秀期刊奖,1996年获全国第二届优秀科技期刊奖,中国科协第二届优秀科技期刊奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16081