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组织特异性蛋白质复合体的识别
  • ISSN号:0255-7797
  • 期刊名称:《数学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:O212.4[理学—概率论与数理统计;理学—数学] O212.5[理学—概率论与数理统计;理学—数学]
  • 作者机构:[1]武汉大学数学与统计学院,湖北武汉430072, [2]华中师范大学数学与统计学学院,湖北武汉430079, [3]华中农业大学理学院,湖北武汉430070
  • 相关基金:国家自然科学基金资助(11275259);国家自然科学基金资助(91330113).
中文摘要:

本文研究了组织特异性蛋白质复合体的识别问题.利用蛋白质相互作用网络数据以及组织特异性基因表达数据构建组织特异性蛋白网络,利用多种代表性聚类算法对该网络进行聚类,并利用非负矩阵分解对聚类结果进行合并聚类,得到了组织特异性蛋白质复合体.结果表明,聚类效果得到明显提升,并且能识别出组织特异性蛋白质复合体.

英文摘要:

In this paper, we study the identification problem of tissue-specific protein complexes. By using a variety of typical clustering algorithm to cluster the network, we construct a tissue-specific protein-protein interaction network based on the protein-protein interaction net- works as well as the tissue-specific gene expression data, then merge the results with non-negative matrix factorization model to obtain tissue-specific protein complexes. The results show that clustering effect has been significantly improved, and can identify tissue-specific protein complexes.

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期刊信息
  • 《数学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:武汉大学 湖北省数学学会 武汉数学学会
  • 主编:陈化
  • 地址:湖北武汉大学
  • 邮编:430072
  • 邮箱:jmath@whu.edu.cn
  • 电话:027-68754687
  • 国际标准刊号:ISSN:0255-7797
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1163/O1
  • 邮发代号:38-71
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国数学评论(网络版),德国数学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:3910