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龙眼胚性愈伤组织Cu/Zn-SOD分子伴侣基因CCS的克隆及其在体胚发生过程中的表达分析
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:应用与环境生物学报
  • 时间:2012
  • 页码:351-358
  • 分类:Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.31078717);高等学校博士学科点专项科研基金(No.20093515110005);福建省农业科技平台建设项目(No.2008N2001)资助~~
  • 相关项目:龙眼体胚发生过程中miRNA的分离与鉴定
中文摘要:

为了解Cu/Zn超氧化物歧化酶分子伴侣基因(CCS)在龙眼体胚发生过程中的表达调控机制,以龙眼松散型胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR法,克隆了长960 bp含有完整开放阅读框的龙眼DlCCS核酸序列,其编码一个含有319个氨基酸的蛋白质(GenBank登录号:FJ973472).生物信息学分析显示:该蛋白为亲水的、稳定的、含有跨膜结构域的酸性蛋白质,定位于叶绿体;与毛果杨、葡萄、拟南芥、水稻和锦鸡儿具有较高同源性,含有植物CCS蛋白所特有的3个保守结构域;预测其通过不同的磷酸化方式,改变酶活性及蛋白构象,参与龙眼体胚中超氧化物代谢以及金属离子转运等生物学过程,在氧化还原过程中发挥作用.利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术研究该基因在龙眼体胚发生发育过程中的表达情况,结果显示,从松散型胚性愈伤组织(Stage 1)到胚性紧实球形结构阶段(Stage 4),DlCCSmRNA的转录水平较低且波动小;当胚性紧实球形结构进一步发育到子叶形胚阶段(Stage 8),其表达量迅速增加,在成熟胚阶段(Stage 9)达到最高峰,提示DlCCS可能在龙眼体胚的中晚期起主要作用

英文摘要:

Copper chaperone for superoxide dismutase gene(CCS) was cloned and its expression level was analyzed for elucidating its role during longan somatic embryogenesis.DlCCS gene was isolated by RT-PCR,containing a 960-nucleotideslong open reading frame(ORF) which encoded a protein of 319 amino acid residues.Bioinformatics analysis showed that the protein encoded by DlCCS with the signal peptide and transmembrane helices was hydrophilic,stable and acidic protein,located in the chloroplast.Homology researches with the deduced amino acid residues indicated that DlCCS gene had a high similarity to other plant CCS genes,and the predicted DlCCS polypeptide contained 3 distinct domains.The phosphorylation occurred mainly on serine,followed by threonine and thyosine residues.The DlCCS protein was involved in superoxide metabolism and metal ion transport process,and played a role of oxidation-reduction during longan somatic embryogenesis.qPCR results indicated that DlCCS was expressed at low levels from the friable-embryogenic callus(Stage 1) to the compact pro-embryogenic cultures(Stage 4).With further embroygenic development,its expression increased rapidly and peaked at the mature embryo stage(Stage 9),suggesting that DlCCS might play a major role in the middle and late developmental stages of longan somatic embryogenesis.

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016