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龙眼生长素应答因子基因克隆及其在体胚中的表达分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:西北植物学报
  • 时间:2012.12.12
  • 页码:2383-2389
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学] Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002, [2]福建省亚热带植物研究所,福建厦门361006
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31071787,30471204);福建省重大科技平台建设项目(2008N2001)
  • 相关项目:龙眼体胚发生过程中miRNA的分离与鉴定
中文摘要:

以龙眼胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR结合RACE法克隆生长素应答因子基因(auxinresponsefac-tor,即DL-ARFl),运用生物信息学方法对序列进行分析,并通过实时荧光定量PCR法研究其在龙眼体细胞胚胎发生过程中的表达。结果表明:DL-ARF1基因的mRNA全长序列为2695bp(GenBank登录号GQ923778),包含2046bp开放阅读框,163bp5’非编码区(5’UTR),486bp3’非编码区(3’UTR);推定的氨基酸序列含681个氨基酸,与其它植物ARF基因相似性达40%~81%。DL-ARF1基因可能属于转录抑制因子,在龙眼体胚的各阶段均有表达,整个变化趋势呈双峰形,在胚性愈伤Ⅱ(Stage2)中的表达量最高。

英文摘要:

The auxin response factor gene (DL-ARF1) was cloned from embryogenic calli of longan (Dimo- carpus longan Lour. ) by the RT-PCR with RACE method. The obtained sequence and putative amino acid sequence were analyzed by bioinformatics methods. Then the mRNA transcription level of the gene in the process of somatic embryogenesis was determined by qRT-PCR (real-time reverse transcription PCR) method. The results were as follows: The full length mRNA sequence of DL-ARF1 gene(GenBank, GQ923778) was about 2 695 bp,consisting of an open reading frame(ORF) of 2 046 bp,5' and 3' untrans- lated regions(UTR) of 163 bp and 486 bp,respectively. The putative protein had 681 amino acids,and the i- dentity with other polypeptides varied between 40% ~81%. DL-ARF1 gene was probably belonged to the transcription inhibitor and expressed in 8 different stages during somatic embryogenesis,which showed ap- proximately a bimodal curve. The peak mRNA transcription level of DL- ARF1 gene occurred at the em- bryogenic callus ]1 (Stage 2).

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104