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基因表达分析稻瘟病菌中8个假定RhoGAP蛋白与几丁质合酶的关系
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q[生物学]
  • 作者机构:[1]福建农林大学生命学院,福州350002, [2]福建农林大学植物保护学院,福州350002, [3]中国热带农业科学院椰子研究所,文昌571339
  • 相关基金:本研究由国家自然科学基金(31500118,31571943)资助
中文摘要:

通过分析稻瘟病菌RhoGAP家族基因与几丁质合酶家族基因的表达关系,研究该家族基因对细胞壁形成的影响。利用不同生物信息学软件对RhoGAP家族进行序列分析,运用RT.PCR技术获得了该家族基因的部分eDNA序列,通过实时荧光定量技术分析RhoGAP基因与几丁质合酶基因的表达关系。结果表明,稻瘟病菌数据库中8个RhoGAP基因均含有保守的GAP结构域,且为水溶性蛋白,蛋白分子量相对较大,系统进化分析结果显示,16个RhoGTP酶激活蛋白可分为两类;不同的几丁质合成酶基因在不同RhoGAP基因突变体中的表达量不同,总的趋势是上调的。说明RhoGAP基因家族蛋白可能参与了稻瘟病菌不同阶段细胞壁的合成,本结果为进一步研究RhoGAP家族基因参与多样性的代谢途径奠定了基础。

英文摘要:

The objective of this study was to explore the influence of Rho GTPase activating proteins (RhoGAPs) on cell wall formation from expression level between RhoGAPs and chitin synthase members. Structure characteristics and properties of RhoGAP members and expression profile between RhoGAPs and chitin synthases were analyzed by bioinformatics and Real-time PCR in Magnaporthe oryzae. Eight putative RhoGAPs in M. oryzae contain conserved GAP domain and belong to WSP (water-soluble protein) with high molecular weight. Total 16 RhoGAP proteins were systematically identified into two classes. Real-time PCR showed that chitin synthase genes had differential expression levels in different mutants of RhoGAP members. RhoGAP members may involve in the synthesis of cell wall in the fungal different development stages. Our this work are helpful for studying the regulations of diverse metabolic pathways of RhoGAP members.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299