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伪狂犬病病毒立即早期180基因的克隆及序列分析
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:《中国畜牧兽医》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华南农业大学兽医学院,广东广州510642
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31001074);广东省科技计划项目(20088020600003).
中文摘要:

为了研究伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)立即早期180基因(immediate early 180,IE180)及其功能,试验采用设计的特异性引物通过PCR法对IE180基因进行扩增,并成功构建了IE180克隆载体,经序列测定后,用DNAStar软件对该序列和已发表的7个PRV参考株的IE180基因核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行比对分析。结果表明,HB-98株IE180基因编码区大小为4425 bp,编码1474个氨基酸,与GenBank中登录的参考株的IE180基因核苷酸同源性为98.4%~99.1%,氨基酸同源性为97.8%~98.4%。系统进化树分析结果表明,该毒株与毒株TNL(登录号:AF352564.2)的亲缘关系较近。

英文摘要:

To study immediate early 180 (IE180) gene of pseudorabies virus (PRV) and its function,IE180 gene was amplified by PCR method with designed specific primers, and then IE180 cloning vector was successfully constructed. After sequence determination, IE 180 gene sequence and amino acid sequence were compared and analyzed by using DNAStar software among seven published PRV reference strains. The results showed that the CDS region of IE 180 gene consisted of 4425 bp, coded 1474 amino acids,the gene and amino acid sequence homologies between HB-98 strain and reference strains were 98.4% to 99.1% and 97.8% to 98.4%. Phylogenetic tree analysis demonstrated that HB-98 strain was genetically closely related to TNL strain(AF352564.2).

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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619