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哺乳动物中不同表达丰度外显子的进化特征
  • 期刊名称：云南大学生物资源保护与利用重点实验室; 人类遗传学研究中心; 深圳-北京基因组研究所; 中国科学院昆
  • 时间：0
  • 页码：31-39
  • 语言：中文
  • 分类：Q756[生物学—分子生物学] Q959.8[生物学—动物学]
  • 作者机构：[1]云南大学生物资源保护与利用重点实验室,人类遗传学研究中心,昆明650091, [2]深圳-北京基因组研究所,深圳518083, [3]中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化重点实验室,中德马普青年科学家小组,昆明650223
  • 相关基金：国家自然科学基金（批准号：30871342,30663376和30740420553）、“西部之光”项目和云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目（编号：2008PY025）资助.部分经费来自张晓妍的国家基础科学人才培养基金（编号：J073652）和云南大学生命科学实验教学示范中心创新实验项目.致谢 感谢赵若苹和张越在本研究中提供的技术支持.
  • 相关项目：果蝇CG12765基因功能和分子机制的研究
作者： 叶葭|李昕|张晓妍|俞海菁|方林|李洁|郑冰蓉|胡卫红|肖春杰|
关键词： 外显子, 进化, 序列相似度, phastCons, Ka/Ks
中文摘要：

通过比较基因组学方法,利用哺乳动物基因组数据对不同表达丰度外显子的进化特征进行了研究.以非编码区和假基因为对照,对外显子进行序列相似度、phastCons和Ka/Ks分析,结果显示,高表达外显子十分保守而低表达和低表达的外显子也在物种间表现出保守的进化特征.低表达丰度的外显子构成了物种转录组中大多数的转录本种类,结果显示它们的进化都受到功能限制,暗示它们可能在生物进化过程中为增加生物复杂度做出贡献.

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