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人类狼疮性肾炎全血基因表达研究中内参基因的优化选择
  • ISSN号:1000-8861
  • 期刊名称:免疫学杂志
  • 时间:2013.4.1
  • 页码:327-337
  • 分类:R692.6[医药卫生—泌尿科学;医药卫生—临床医学;医药卫生—外科学]
  • 作者机构:[1]暨南大学第一临床医学院,广州510630, [2]右江民族医学院附属医院重症医学科,百色533000, [3]右江民族医学院附属医院肾内科,百色533000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(81160013/H0111)
  • 相关项目:Fractalkine参与脂多糖介导的急性肺损伤信号转导机理的研究
中文摘要:

目的探讨不同病理类型、不同活动程度的狼疮性肾炎患者全血基因表达研究中常用内参基因的优化选择。方法选取不同病理类型、不同活动程度的狼疮性肾炎患者共20例,设正常对照5例。运用实时PCR技术检测全血中10个内参基因(B2M、EEFlAl、PPIB、GAPDH、ACTB、HPRTl、HMBS、GNB2L1、PGKl、TBP)的表达,采用geNorm软件对基因表达的稳定性进行分析。结果10个内参基因在不同患者及正常人全血中的表达存在差异,geNorm软件计算M值和V。,值。10个内参基因的M值均小于1.5,稳定性由低到高依次为ACTB〈HMBS〈TBP〈EEFlAI〈GNB2LI〈PPIB〈B2M〈GAPDH〈HPRTl和PGKl。V〈0.15作为阀值,由于V34=0.149,本研究中内参基因的数量至少需要3个基因,即最稳定的内参基因GAPDH、HPRTl与PGKl。结论人类狼疮性肾炎全血基因表达研究中的内参基因应选择GAPDH、HPRTl与PGKl。

英文摘要:

Gene expression studies require appropriate normalization methods with stable expressed genes as reference. Since suitable reference genes appear to be unique for each tissue, we have identified an optimal set of the most stably expressed genes in blood of human lupus nephritis that can be used for normalization. By using real-time PCR, we detected total of 10 reference genes (B2M, EEF1A1, PPIB, GAPDH, ACTB, HPRT1, HMBS, GNB2L1, PGK1, TBP) expression in blood of 5 healthy adults and 20 lupus nephritis patients with different pathological types and activity levels. Furthermore, the stability of gene expression was analyzed by geNorm software. The results indicated that expression levels of 10 reference genes varied in whole blood of different patients and healthy person. And geNorm software demonstrated the M values of 10 genes were less than 1.5, and stability rank from low to high is ACTB 〈 HMBS 〈 TBP 〈 EEF1A1 〈 GNB2L1 〈 PPIB 〈 B2M 〈 GAPDH 〈 HPRT1 and PGK1. Threshold value was set as V 〈 0.15. The number of reference genes in this study was at lest three genes confirmed by V34=0.149. The three most stable reference genes were GAPDH, HPRT1, and PGK1. This study might prove that GAPDH, HPRT1 and PGK1 should be the optimized reference genes in blood gene expression studies of human lupus nephritis.

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期刊信息
  • 《免疫学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:第三军医大学
  • 主办单位:第三军医大学 中国免疫学会
  • 主编:吴玉章
  • 地址:重庆市沙坪坝高滩岩
  • 邮编:400038
  • 邮箱:richard@mail.tmmu.com.cn
  • 电话:023-68752237
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8861
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1332/R
  • 邮发代号:78-32
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊三等奖,全军优秀医学期刊奖,重庆市优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13273