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应用DNA芯片技术研究体外表达禽致病性大肠杆菌可能致病基因
  • ISSN号:0001-6209
  • 期刊名称:微生物学报
  • 时间:0
  • 页码:103-111
  • 语言:中文
  • 分类:Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室,扬州225009, [2]淮阴师范学院生物系,淮安223001
  • 相关基金:国家“863计划”(2003AA222141);国家自然科学基金(30471281,30771604)
  • 相关项目:基于APEC的UPEC毒力基因贮库的研究
中文摘要:

应用DNA芯片研究禽致病性大肠杆菌可能致病基因的表达。构建禽致病性大肠杆菌毒力基因、潜在毒力基因的DNA芯片,应用基因芯片技术对同属02血清型的禽高致病性大肠杆菌E058株和低致病性大肠杆菌E526株在体外LB培养基和鸡血清培养状态下进行差异表达分析。结果:在体外LB静置培养状态下,低致病株E526与高致病株E058相比共有16个差异基因,均为下调基因。在鸡血清静置培养中,E526与E058相比共有15个差异基因,均为下调基因。应用基因芯片成功筛选了禽致病性大肠杆菌在体外不同条件下的毒力基因及可能毒力基因中差异表达基因,表明一些铁摄取系统相关基因对APEC的毒力较重要,同时也筛选出了一些新的可能致病基因aes-1,aes-2,aes-3,aes-4,aes-6,aes-8,aes-10,aes-13,aes-15,aes-31等。

英文摘要:

We constructed avian pathogenic Escherichia coli (APEC) specific DNA microarray to analyze the transcriptomes of APEC highly pathogenic strain E058 and low pathogenic strain E526 (both belonging to 02 serotype). For cultures in Luria-Bertani (LB) broth medium, 16 distinctly expressed genes were observed in strain E526, and all of them were down-regulated. For cultures in the serum of chickens, 15 distinctly expressed genes were screened in strain E526, and all of them were also down-regulated. The results suggest that DNA microarray could be used to screen distinctly expressed genes among virulence- and potential virulence-associated genes of APEC. The expression of 11 common virulence- or potential virulence-associated genes were down-regulated for strain E526 compared to those of strain E058 cultured both in LB broth and chicken serum. Meanwhile, 4 potential virulence-associated genes,aes-3,aes-lO,aes-13 and aes-15 were down-regulated for strain E526 but not for strain E058, when they grew in the chicken serum. Besides known virulence factors, we observed 10 new potential virulence-related genes including aes-1, aes-2, aes-3, aes-4, aes-6, aes-8, aes-lO, aes-13, aes-15 and aes-31.

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期刊信息
  • 《微生物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国微生物学会 中国科学院微生物研究所
  • 主编:谭华荣
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路3号中国科学院微生物研究所B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:actamicro@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807516
  • 国际标准刊号:ISSN:0001-6209
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1995/Q
  • 邮发代号:2-504
  • 获奖情况:
  • 国家优秀期刊二等奖,中科院优秀期刊二等奖,中国科协首届优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21879