选择我国禽源大肠杆菌优势血清型O78、O2高、低致病株分别作为试验方、驱赶方,进行抑制性消减杂交,建立高致病性O78、O2分离株基因组消减文库;对消减文库中差异性基因片段进行序列分析并与GenBank中大肠杆菌已知基因序列进行同源检索,寻找可能的新致病基因;对所筛选基因进行突变构建成突变株,并以经典生物学试验判定突变株致病性变化,从而,确定禽病原性大肠杆菌新的致病基因。通过本项目的研究,可进一步揭示禽病原性大肠杆菌的分子致病机理,从而为该病的有效控制开辟新途径;同时,本项目的实施将有助于建立我国畜禽病原菌致病基因研究的技术平台。
采用抑制差减杂交技术(SSH)对禽致病性大肠杆菌(APEC)E037株(O78血清型)与非致病菌株K-12以及同一O2血清型高致病菌株E058与低致病菌株E526进行基因组差异片段克隆与分析,从E037株共获得17个差异片段,E058株共检出32个特异性差异片段,这些片段涉及APEC已知毒力基因,如大肠杆菌素、气杆菌素受体、铁基因簇等,同时,也包含潜在的新毒力基因。应用选择性捕获转录序列(SCOTS)鉴定出了APEC E037株在感染SPF鸡过程中的转录表达基因,共获得31个转录序列,多数属已知致病基因,少数为潜在的新致病基因。构建的通过SSH方法筛选出的已知毒力基因tsh、iro突变株在鸡体的攻毒试验表明,tsh、iro的突变能明显降低APEC的致病力;以SSH法从APEC E037株获得的功能未知基因片段ecs-8和从APEC E058株获得的功能未知基因片段aes-31,突变后接种SPF鸡,与亲本株比,E037(△ecs-8)的毒力下降,而E058(△aes-31)的毒力上升,表明这些基因片段与APEC的毒力相关。SSH、SCOTS方法获得的更多潜在的新毒力基因正在鉴定中。