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鸭疫里默氏菌病和大肠杆菌病鉴别诊断双重PCR方法的建立和应用
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:《畜牧兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.618[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]广东省农业科学院兽医研究所,广州510640, [2]广东省兽医公共卫生实验室,广州510640
  • 相关基金:广东省自然科学基金博士启动项目(04300906);广东省科技攻关项目(20401004)
中文摘要:

本研究从鸭疫里默氏菌提取基因组DNA,采用细菌16S rRNA基因的通用引物,用PCR方法成功扩增出鸭疫里默氏菌的部分16S rRNA基因,克隆及测序结果表明其全长1512bp,G+C含量为51%,该序列已登人GenBank,登录号为DQ078779。同时利用生物软件对GenBank收录的鸭疫里默氏菌和大肠杆菌的16S rRNA基因序列进行分析后,设计了鸭疫里默氏菌和大肠杆菌的种特异性引物,分别能从各自的16S rRNA基因中扩增出长度为342和718bp的DNA片段。并据此建立了一种能快速准确鉴别诊断鸭疫里默氏菌和大肠杆菌病的双重PCR方法,该方法能从肝脏组织悬液煮沸后的上清、细菌培养物或提取的细菌基因组DNA中快速扩增出相应的片段,进行鉴别诊断。

英文摘要:

In this study, partial sequence of Riemerella anatipestifer 16S rRNA gene was amplified by polymerase chain reaetion(PCR) using the bacteria 16S rRNA gene universal primers, which its length was 1 512 base-pair (bp) and it has been recorded in GenBank and named as DQ078779. The BLAST analysis indicated that DQ078779 was the most similarity with reported 16S rRNA gene of R. anatipestifer. Moreover, species-specific primers were designed according to BLAST results of different 16S rRNA gene sequences of R. anatipestifer and E. coli, which 354 and 718 bp specific DNA fragment could be amplified by the two pairs of primers from R. anatipestifer and E. coli, respectively. Finally, dulex PCR with the specific primer for differentiating R. anatipestifer and E. coli infection in ducks was established, and genomie DNA or cul- tured bacteria or boiled liver tissue of ducks infected by R. anatipestifer and E. coli could be used as template.

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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857