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4.1R基因敲除小鼠血液生理生化参数分析
  • ISSN号:1671-6825
  • 期刊名称:《郑州大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:R735.1[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]郑州大学基础医学院,河南郑州450001, [2]郑州大学生命科学学院,河南郑州450001, [3]郑州大学医药科学研究院,河南郑州450052
  • 相关基金:国家自然科学基金(81172784);国家大学生创新创业训练计划(201310459014).
中文摘要:

目的:利用生物信息学技术预测设计特异抑制survivin蛋白表达的siRNA序列,瞬时转染食道癌细胞KYSE.70,并观察对survivin蛋白表达的沉默效果。方法:依据NCBI数据库获得的survivinmRNA序列,利用Whitehouse,Sidirect和RationalSiRNADesign软件预测设计siRNA干扰序列,并利用BLAST分析干扰序列与人类全基因组的同源性;转染食管癌细胞KYSE-70,Westernblot法鉴定蛋白表达。结果:初步预测出3条含21个核苷酸的survivin干扰序列,瞬时转染食道癌细胞KYSE-70后survivin蛋白表达明显下降。结论:运用生物信息学技术可快速便捷预测出抑制survivin表达的siRNA序列,为研究survivin在食管癌发生发展中的作用奠定了基础。

英文摘要:

Objective: To predict and design the siRNA sequence by using the bio-informatics technology for inhibition of survivin protein expression, observe the effects of transfecting siRNA into e- sophageal cancer cell line KYSE-70 on silencing survivin protein expression. Methods: According to the survivin sequence obtained from NCBI database, Whitehouse, Sidirect and Rational SiRNA Design software were used to predict the siRNA interference sequence and followed by homological analysis with BLAST. SiRNA was transfected into esophageal cancer cell line KYSE-70. Survivin protein expression was examined by western blot. Results: 3 survivin interfere RNA sequences in- cluding 21 nucleotides were predicted. Western blot showed that the expression of survivin protein in KYSE-70 cells decreased significantly after transfection with siRNA. Conclusion : The bio-infor- matics technology can be conveniently employed for survivin siRNA design which could promote the further study on the occurrence and development of esophageal cancer.

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期刊信息
  • 《郑州大学学报:医学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:河南省教育厅
  • 主办单位:郑州大学
  • 主编:辛世俊
  • 地址:郑州市高新区科学大道100号
  • 邮编:450001
  • 邮箱:xzshi@126.com
  • 电话:0371-67781728
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-6825
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1340/R
  • 邮发代号:36-111
  • 获奖情况:
  • 综合性医药卫生类核心期刊,教育部优秀科技期刊一等奖,中国优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15607