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MaLDA:基于LDA的用药分析
  • ISSN号:1002-8331
  • 期刊名称:《计算机工程与应用》
  • 时间:0
  • 分类:TP39[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]复旦大学计算机科学技术学院,上海201203, [2]上海市数据科学重点实验室,上海201203, [3]上海市金融信息技术研究重点实验室(上海财经大学),上海200433
  • 相关基金:国家高技术研究发展计划(863)(No.2015AA020105);国家自然科学基金(No.91546105,No.71331005);上海市科委基金(No.14511107302);上海市数据科学重点实验室开放课题资助课题(No.201509060001);NSFC-广东联合基金(第二期)超级计算科学应用研究专项资助;国家超级计算广州中心支持.
中文摘要:

为了给医生及病人安全、合理、高效用药提供决策支持,提出了一种基于LDA(Latent Dirichlet Allocation)的用药分析方法MaLDA(Medication Analysis based on LDA)。该方法结合了用药记录和就诊记录,将药物看作文档、药物功能看作主题、疾病看作词语,通过主题模型LDA发现隐含的药物功能,通过药物功能,将相关药物、相关疾病和药物与疾病联系起来。根据药物对药物功能的分布对药物进行聚类,每一类药物被相关的疾病所描述,进而对临床用药进行分析。MaLDA不仅能发现临床用药中针对某一类疾病效用较好的药物,而且能发现隐含的联合用药。实验数据来源于上海市某医院137510位病人的用药记录和就诊记录。实验结果证实了MaLDA相对于其他方法在对电子就医记录进行用药分析的有效性。

英文摘要:

To provide support for doctors and patients to use drugs in a safer, more rational and efficient way, this paper proposes a framework for medication analysis based on LDA(Latent Dirichlet Allocation), MaLDA(Medication Analysis based on the LDA). MaLDA combines the usage of medication records and diagnostic records, infers the function of each drug using topic-based inference model LDA, which regards a drug as a document, a function as a topic, and a disease as a word. As a result, related drugs, drug and disease, related diseases are associated by functions. Then clustering all drugs according to its distribution of functions, and each cluster is described by related diseases. Finally, it analyzes the clinical medication based on the results of clustering. The result generated by MaLDA can not only find the drug which is better in treatment, but also find the drug combination which lays the foundation for mining drug side effects and the complications of disease. The method is evaluated by using 137 510 patients’diagnostic records and medication records. The results justify the advantages of MaLDA over baseline methods on medication analysis.

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期刊信息
  • 《计算机工程与应用》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国电子科技集团公司
  • 主办单位:华北计算技术研究所
  • 主编:怀进鹏
  • 地址:北京市海淀区北四环中路211号北京619信箱26分箱
  • 邮编:100083
  • 邮箱:ceaj@vip.163.com
  • 电话:
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-8331
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2127/TP
  • 邮发代号:82-605
  • 获奖情况:
  • 1. 2012年首批获得中国学术文献评价中心发布的 “...,2. 2001年获得新闻出版署“中国期刊方阵双效期刊”,3. 2008年首批入选国家科技部“中国精品科技期刊...,4.2003年-2011年连续获得工业和信息化部期刊最高...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:97887