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RNA二级结构点括号图与CT文件表示法的相互转换算法研究
  • ISSN号:1671-1114
  • 期刊名称:天津师范大学学报(自然科学版)
  • 时间:2012.10
  • 页码:32-36
  • 分类:TP399[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]天津师范大学计算机与信息工程学院,天津300387
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(61070089,61103074); 天津市自然科学基金资助项目(11JCYBJC00600); 天津师范大学校博士基金资助项目(52X09012,52XB1102); 上海市高可信计算重点实验室开放课题资助项目(53H10058)
  • 相关项目:基于语音信号和事件相关电位技术的多模态情感识别研究
中文摘要:

由于RNA二级结构表示方法对其功能和相似性的研究具有关键性作用,通过对现有RNA二级结构的各种表示方法进行讨论,重点介绍了点括号图表示法和二级结构平面图文本(CT文件)表示法,给出二者之间的相互转换算法,并通过实例验证了该转换算法准确、有效,可为研究RNA二级结构的相似性提供有效的数据支持.

英文摘要:

The representation of RNA secondary structure playes a key role in the research on its functions and similarity.Several current representations of RNA secondary structure are discussed.The representations of Dot-Bracket notation and CT file are mainly introduced,and the transforming algorithms of the two representations are given.The accuracy and effectiveness of the algorithms are verified by using an example,and the algorithms provide data supports in the research on similarity of RNA secondary structure.

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期刊论文 15 会议论文 8 专利 1
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期刊信息
  • 《天津师范大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:天津市教育委员会
  • 主办单位:天津师范大学
  • 主编:高玉葆
  • 地址:天津市河西区吴家窑大街57号增一号
  • 邮编:300074
  • 邮箱:tjsdxbz@126.com
  • 电话:022-23766780
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-1114
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1337/N
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中国科技论文统计源期刊,中国数学文摘期刊源,中国物理文摘期刊源
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:2306