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一株H3N2犬源猫流感病毒NP基因的遗传变异性分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S852.655[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]华南农业大学兽医学院,广东广州510642
  • 相关基金:国家公益性行业科研专项(201303042);国家自然科学基金(30972233);广东省农业攻关项目(2010802030700);广东省科技计划项目(20118020306007);广东省自然科学基金(S2012020011111)
中文摘要:

从被感染猫体内分离出流感病毒,利用RT—PCR扩增NP基因,分析其遗传变异性。与NCBI上的14株流感病毒的NP全基因序列进行比对分析,发现其与参考毒株的NP基因序列的相似性为79.3%-99.7%,其中与感染株A/canine/Guangdong/1/2007(H3N2)的NP基因序列的相似性最高,为99.7%。基因序列比对发现,编码区存在5处突变:A33G、A81G、C235T、G345A、A567G:氨基酸仅存在1处变异:1189M。研究结果表明,犬流感病毒在犬和猫之间存在跨中间传播,虽然变异系数不高,但是567位碱基突变所造成的氨基酸突变为NP基因的遗传性和种间特异性的研究提供了参考。

英文摘要:

The study mainly discussed the genetic variation of NP gene of H3N2 subtype feline influenza virus after infection of canine-origin influenza virus. The feline was artificially infected with H3N2 subtypes canine influenza virus. The full length of NP gene was compared with the other 14 different types of influenza viruses in the Genbank datebase. The results revealed that similarity between each other was ranging from 79.3% to 99.7%. The nueleotide identity between infection and inoculation A/canine/Guangdong/1/2007 (H3N2) was the highest (99.7%). After the comparison of gene sequence, five mutations were found in the coding region (A33G, A81G, C235T, G345A, A567G). However, only one amino acid mutations was found (I189M). The results showed that canine influenza virus can spread across species, although the variation of NP gene was not significant, but the amino acids mutations caused by the 567 base provide reference statistics for the study of heredity and Species-specific of NP gene.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995