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少量胃癌细胞SHP1基因启动子区CpG岛甲基化的状态
  • ISSN号:1000-8578
  • 期刊名称:《肿瘤防治研究》
  • 时间:0
  • 分类:R735.2[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]上海交通大学生物医学工程学院, [2]上海交通大学系统生物医学教育部重点实验室
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(91019004,91229123);国家中医临床研究基地“龙医团队”项目资助课题(LYTD-21);国家重点基础研究发展计划(2013CB967402);教育部留学回国人员基金(13Z102050008)
中文摘要:

目的检测胃癌细胞中SHP1基因启动子区CpG岛异常甲基化状态。方法使用甲基化分析软件Cpgplot预测SHP1基因转录起始位点-1 000 bp~1 340 bp区域的CpG岛并用MethPrimer软件设计甲基化特异性PCR(MSP)引物;建立一种基于Bisulfite修饰、无需提取DNA而直接检测少量细胞甲基化的新方法,并将其用于胃癌细胞SHP1基因启动子区甲基化状态的检测;克隆MSP产物、Sanger测序、分析测序峰图;比较Bisulfite修饰前后序列并分析CpG位点甲基化状态。结果 MSP引物均位于SHP1基因第一外显子区近转录起始位点;CpG岛长度】200 bp、GC含量】50%、Obs/Exp】0.60;MSP检测仅出现甲基化引物特异性扩增条带,提示该区域高甲基化。结论胃癌细胞中SHP1基因启动子区CpG岛存在高甲基化。

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期刊信息
  • 《肿瘤防治研究》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生部
  • 主办单位:湖北省卫生厅 中国抗癌协会 湖北省肿瘤医院
  • 主编:魏少忠
  • 地址:武昌卓刀泉南路116号
  • 邮编:430079
  • 邮箱:zlfzyj@263.net.cn
  • 电话:027-87670126
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8578
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1241/R
  • 邮发代号:38-70
  • 获奖情况:
  • 中国学术期刊综合评价数据库来源期刊,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:17449