非可控性炎症在肿瘤发生发展过程中发挥重要作用,研究由编码转录因子的多基因所组成的转录调控网络驱动炎症引起细胞恶性转化的调控规律将有助于阐明细胞癌变的分子机制。本项目以胃黏膜相关淋巴组织(MALT)淋巴瘤为研究对象,通过CAGE技术构建胃MALT淋巴瘤的CAGE文库,经高通量测序获得全基因组范围的启动子表达信息,利用生物信息学分析预测启动子区域的转录因子结构域(motif),通过数学拟合计算motif活性,运用贝叶斯概率统计理论分析转录因子基因之间的调控关系从而构建动态的转录调控网络;研究转录因子在全基因组范围的结合位点及靶基因,构建转录因子主导的子网络,发现炎症恶性转化相关的核心子网络;通过RNAi干预等体内外实验验证关键节点分子。本研究运用分子网络作为主要的研究手段,为阐明胃MALT淋巴瘤恶性转化的网络调控机制,揭示炎癌转化的必要条件,探索肿瘤预测及诊断的网络分子标志奠定基础。
英文主题词gastric cancer;malignant transformation;alternative polyadenylation;cancer metastasis;