布鲁氏菌病在我国十多个省份广泛流行,给畜牧业和人类健康带来严重危害。本研究拟前期研究标准菌株基因多态性的基础上,收集不同地区、不同年代和不同宿主来源的布鲁氏菌菌株,尽可能的代表布鲁氏菌种群的多态性。综合使用DNA芯片比较基因组杂交、大规模PCR验证、MLST、MLVA等研究技术,分析基因和位点遗传多态性,进而统计分析各菌株/菌型的系统发育关系,从而了解布鲁氏菌的种群结构。同时,通过比较各菌株的基因组组成,认识基因获得/缺失在基因组进化中的作用(尤其是毒力基因、基因组岛的水平转移),探究布鲁氏菌流行菌株的遗传学特征及变迁规律,为布鲁氏菌遗传进化和传染源的追踪溯源提供有力的遗传学依据。
Brucella;Comparative Genomics;Microevolution;Genotyping;
布鲁氏菌病是一种由布鲁氏菌感染引起的危害严重的人兽共患传染病。本研究围绕布鲁氏菌开展了细菌遗传多态性与微进化的研究。利用包含羊种和牛种基因的全基因组芯片的比较基因组杂交,分析了不同种型布鲁氏菌基因水平的获得与缺失情况,发现不同种型布鲁氏菌进化中存在平行的基因获得与缺失的情况。基于差异基因区段分析,了解了我国分离的布鲁氏菌菌株的基因获得与缺失情况。利用MLST和MLVA方法,对我国的布鲁氏菌分离株进行基因分型研究,我国主要流行的是ST8型,在不同省份和地区流行着不同的主要ST型。最后,综合以上菌株分析数据,以及我国布鲁氏菌病的时空分布图,对我国流行的主要基因型的菌株,以及它们间的遗传进化关系进行了探讨,阐述了布鲁氏菌在我国流行与演化的遗传规律。