位置：立项数据库 > 立项详情页
生物序列分析的高效并行算法研究
  • 项目名称：生物序列分析的高效并行算法研究
  • 项目类别：面上项目
  • 批准号：60273007
  • 申请代码：F020304
  • 项目来源：国家自然科学基金
  • 研究期限：2003-01-01-2005-12-01
  • 项目负责人：郑纬民
  • 负责人职称：教授
  • 依托单位：清华大学
  • 批准年度：2002
中文摘要：

针对生物序列分析中的拼接与比对等问题进行高效并行算法研究，研究序列拼接算法的高效并行化策略和方案，探索两序列比对及多序列比对的高效并行算法，设计性能更好的多序列比对算法，为快速且更准确地处理生物信息提供有力支持，该研究将在绘制生物基因组图，构建系统进化对，发现基因，预测蛋白质结构及功能等领域具有广泛的应用前景。

中文主题词： 生物序列分析；并行算法；并行序列拼接；并行序列比对
结论摘要：

英文主题词Biological sequence analysis; Parallel algorithms; Parallel sequence assembly;Parallel sequence alignment;

成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 8
  • 0
  • 0
  • 0
期刊论文
DNA序列拼接中欧拉超路算法的新并行策略
B^3A： Prompting Cooperation Among Rational Participants in P2P Bulk File Sharing Environments
基于网格的内容传输技术研究
会议论文
Tree Partition based ParallelFrequent Pattern mining on Shared Memory Systems
Parallelization of Module Network Structure Learning and Performance Tuning on SMP
Efficiently Rationing Resources for Grid and P2P Computing.
Paramecium: Assembling Raw Nodes into Composite Cells
A Fine-grained Parallel Programming Model for Grid Computing
基于图划分的全基因组并行拼接软件
欧拉超路法实现DNA测序纠错
基于欧拉超路的并行DNA序列拼接算法
相关项目
大规模非负矩阵分解的优化模型和并行算法研究及应用
期刊论文 21 会议论文 8
并行环境中I/O性能的层次模型及优化I/O策略的研究
期刊论文 11 会议论文 6
基于多核机群的Petri网并行算法的研究与实现
期刊论文 28 会议论文 14
数学物理方程的反问题及其应用
期刊论文 53 会议论文 19 著作 4
交通网络分布式并行微观模拟算法研究与实现
期刊论文 25 会议论文 6
面向异构并行系统的生物序列比对并行策略及算法研究
期刊论文 13 会议论文 6
特征信息发现的并行算法及实现研究
期刊论文 20 会议论文 1
变分不等式及互补问题迭代解法及其收敛性
期刊论文 33 会议论文 5 著作 1
非线性抛物型问题高性能计算的方法和实现
期刊论文 8 会议论文 2
郑纬民的项目
第九届亚太地区计算机体系结构年会
生物信息学
生物信息学
分辨元等问题的高速计算及其Web索引应用
期刊论文 1
对等计算及广域网虚拟平台
期刊论文 86 会议论文 67
多核处理器系统的流式优化研究
期刊论文 2 会议论文 5
大规模存储系统性能测试方法与技术研究
期刊论文 25 会议论文 1
并行面向对象模型和语言的研究
期刊论文 4
网络计算程序的编译与执行模式的研究
期刊论文 6