硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因是研究哺乳动物脂肪沉积性状的重要候选基因之一。本项目在申请者已定位、分离和克隆猪SCD全长基因的工作基础上,利用自身构建的白色杜洛克×二花脸资源家系500 F2个体,及杜洛克、长白、大白猪三个育种核心群240个个体为实验材料,检测其在SCD基因编码区和调控区内5个SNPs位点的遗传变异,判定资源家系群体在SCD基因临近染色体区域3-5个微卫星位点的基因型。利用最小二乘分析,研究各类基因型和单倍型与资源家系群体的240日龄体重的的肩部、第6-7肋骨、最后肋骨及髋关节处的四点背膘厚,腹部脂肪重,板油重,花油重等脂肪沉积性状的关联性,以及与商业猪群校正活体背膘厚的相关性;并对SCD基因临近区域进行影响脂肪沉积的QTL定位分析。同时,研究SCD基因在脂肪沉积性状差异极显著的两类基因型或单倍型个体的表达差异,最终揭示SCD基因在不同群体中对猪脂肪沉积性状的影响效应。
本项目分析了白色杜洛克X二花脸资源家系群体1021F2个体和杜、长、大三个商业群体320个个体在猪SCD基因5个SNP位点的遗传变异,发现这些多态标记与脂肪沉积性状无显著相关性。进一步定位、分离和鉴别了猪SITR1、NCOR1、NCOR2和SLC6A14等4个与SCD在同一脂肪代谢通路的功能基因,分析了这些基因的SNP标记与脂肪沉积性状的关联性;此外,筛选了鸡SCD、SIRT1和Galant2基因的SNP标记,研究了这些标记与脂肪沉积性状的相关性,发现了与脂肪沉积性状强相关的分子标记,上述结果为猪鸡良种脂肪沉积性状的遗传改良提供了新型标记辅助选择手段。