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线粒体单倍型与高原肺水肿易感性关联分析及其机制研究
  • 项目名称:线粒体单倍型与高原肺水肿易感性关联分析及其机制研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:30900715
  • 申请代码:H2101
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2010-01-01-2012-12-31
  • 项目负责人:罗勇军
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:中国人民解放军第三军医大学
  • 批准年度:2009
中文摘要:

高原肺水肿是(HAPE)一种特发于高原低氧环境的肺水肿,mtSNP与其易感性密切相关,可由少数标签mtSNP(tagSNP)构成单倍群和大量非tagSNP构成单倍型。本课题组在自然基金项目(《线粒体DNA单核苷酸多态性与高原肺水肿易感相关性的研究,30572087 》)的资助下,通过对204例HAPE病人(目前世界上报道最多的HAPE病例)和相匹配的174例健康对照mtDNA单倍群的深入分析,已经成功发现了单倍群B在HAPE病例组中的频率显著高于对照组(P=0.013, OR=2.118,95%CI: 1.194-3.756)。线粒体的单倍群主要用来限制样本的遗传背景,在每个单倍群内有多个非tagSNP构成的风险单倍型组合,本项目拟通过PCR-测序和细胞融合技术研究在单倍群B内的风险单倍型组合与HAPE的易感性的关系以及其在HAPE发病的分子机制,为寻求HAPE的预测方法打下坚实基础。

结论摘要:

高原肺水肿是(HAPE)一种特发于高原低氧环境的肺水肿,mtSNP与其易感性密切相关,可由少数标签mtSNP(tagSNP)构成单倍群和大量非tagSNP构成单倍型。本项目通过PCR-测序研究在单倍群B内的风险单倍型组合与HAPE的易感性的关系以及其在HAPE发病的分子机制,为寻求HAPE的预测方法打下坚实基础。本项目通过PCR-测序,发现mtDNA ND1基因的3397A/G 与3552T/A 多态性与HAPE易感性相关,基因型mtDNA 3397G在HAPE中的频率 (2.3%) 显著高于对照组中的频率 (0%) (P=0.021, OR=2.806, 95% CI=2.443-3.223), 同时也发现基因型mtDNA 3552A在HAPE的频率 (6.8%) 也显著高于在对照组中的频率 (1.7%) (P=0.012, OR=4.198, 95% CI=1.264-13.880)。同时通过PCR-测序,在线粒体单倍群B中, 单倍群亚群B4c (标签SNP为15436A和 1119C) 是HAPE的危险因素,然而单倍群亚群B4b是HAPE的保护因素。同时申请者还发现在mtDNA的单倍群M中,mt5351G和mt 6680C基因型在HAPE病例组频率(12.0%)显著高于其在对照组中的频率(1.6%,P=0.016), 提示在单倍群M中mt5351G和6680C基因型是HAPE发病的危险因素, 是HAPE易感的遗传标记之一。线粒体的功能除了受序列影响外,还有mtDNA的数量相关,申请人通过研究发现HAPE患者血细胞mtDNA的拷贝显著低于平原汉族、移居汉族和世居藏族(P<0.05),提示在高原肺水肿患者中mtDNA的拷贝数降低,可能是高原肺水肿的遗传标记之一, mtDNA的拷贝数受到mtTFA的调节。 通过上述研究,深入了解HAPE发病的线粒体DNA遗传机制。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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