mRNA前体选择性剪接在人类基因组中广泛存在,是调控基因表达、增加蛋白质多样性的重要机制;并且已发现许多人类疾病和mRNA选择性剪接的缺陷有关。SRp38作为一种非典型的SR蛋白,在mRNA前体选择性剪接调控中发挥重要作用,该基因的敲除失活不但影响小鼠胚胎发育,而且使敲除小鼠呈现出人类先天性心脏病的典型特征。我们以SRp38敲除小鼠为研究模型,利用生物化学,分子生物学,生物信息学与生物芯片等手段寻找SRp38在心脏发育中所调控的靶基因以及它们之间的信号传导网络,从剪接调控分子水平上探讨心脏发育和先天性心脏病的发病机制。研究结果不仅对阐明先天性心脏病的病因和发病机理有意义,并且有助于提高疾病的产前诊断、遗传咨询和临床诊断水平。
alternative splicing;muscle development;RNA-seq;;
选择性剪接是真核生物基因表达的重要调控方式,不同发育阶段的mRNA特异性剪接调控可能产生结构和功能很不相同的蛋白异构体,对发育过程进行着精密的调控。心脏发育是发育过程中一个非常重要的部分。本研究通过对发育中的小鼠胚胎心脏(E13.5)的mRNA的高通量测序结果(共计约4000万reads)进行分析,共发现了近3113个基因在心脏发育过程中出现了选择性剪接事件。验证了一个受剪接蛋白SRSF10调控的基因(Lrrfip2)参与肌肉发育调控,推测SRSF10可能通过调控Lrrfip2的剪接,影响心肌发育,导致小鼠心脏发育发生缺陷。