中文摘要：

在所有细胞生命活动中,蛋白质之间的相互作用是必不可少的,它是细胞进行一切代谢活动的基础。蛋白质之间发生相互作用是通过肽段来完成的，我们称之为互作或绑定位点，研究这些互作位点对于理解蛋白质相互作用的机制、蛋白质的功能、药物设计以及蛋白质的进化都有重要的意义。另一方面，细胞活动是一个动态的过程，因此蛋白质互作网络中的结点和边是具有动态结构特性的，只有在时间和/或空间上进行动态分解研究，所构建的网络才能发挥其理论和应用价值。我们以酵母蛋白质组为研究对象，首先对蛋白质的互作位点在模体水平上进行了预测，并对该方法进行了扩充，在模体-模体、模体-结构域和结构域-结构域三个水平上进行了全面分析，在此基础上构建了相关的数据库用于存储与展示这些预测出来的互作位点及其关系。另一方面我们对蛋白质相互作用网络进行了以细胞有丝分裂为时间尺度的分解研究，得到了以细胞周期为单位的子网络以及整个网络的拓扑性质，特别是对不同网络间的关键蛋白(hub protein)进行了比较分析。以上所有结果将为我们今后展开系统遗传学相关方面的研究奠定下良好的基础。